mRNA 시퀀싱
mRNA 시퀀싱 소개
mRNA 시퀀싱(mRNA-Seq)은 질병 상태, 생물학적 과정 및 광범위한 연구 설계에서 전사체를 분석하기 위해 선택하는 방법으로 빠르게 발전했습니다. 유전자 발현을 정량화하는 고감도의 정확한 수단일 뿐만 아니라, mRNA-Seq는 기존에 알려지거나 새로운 전사물 동형, gene fusion 및 기타 특징과 대립 유전자 특이적 발현을 모두 식별할 수 있습니다. 사전 지식의 필터에 의해 제한되지 않는 코딩 전사체에 대한 완전한 관점을 제공합니다. 차세대 시퀀싱(NGS) 기반 mRNA-Seq는 기존 지식에 따라 여과되지 않은 코딩 전사체에 대한 종합적인 관점을 제공합니다.
Sifting Through Cells
Norma Neff 박사는 스탠포드 대학의 연구자들이 초기 개발을 이해하기 위해 단일세포 mRNA-Seq를 사용하는 방법에 대해 논의합니다.
인터뷰 읽어 보기mRNA 시퀀싱의 장점
mRNA-Seq은 전사체 분석에서 유전자 발현 어레이에 비해 여러 가지 이점을 제공합니다.
- 더 광범위한 동적 범위를 제공하여 유전자 발현의 배율 변화를 보다 민감하고 정확하게 측정할 수 있습니다.
- 알려진 특징과 새로운 특징을 모두 포획합니다
- 다양한 종에 적용 가능
어레이에서 mRNA-Seq으로 전환
Expression Analysis로 개발된 도구는 mRNA-Seq 결과를 이전 어레이 데이터와 쉽게 비교할 수 있는 방법입니다.
인터뷰 읽어 보기전사체에 대한 정확한 고해상도 보기
비율 압축은 동적 범위를 줄이고 측정된 전사 변화를 가리거나 변경할 수 있는 유전자 발현 어레이의 확립된 기술적 한계입니다.1–3 반면, mRNA-Seq는 이러한 편향의 영향을 받지 않으며 유전자 발현 변화를 보다 포괄적이고 정확하게 측정할 수 있습니다.
또한, mRNA-Seq는 가닥 정보를 제공하여 역배열 발현을 검출하고, 중복되는 전사물을 보다 정확하게 정량화할 수 있으며, 정렬 가능한 리드(read)를 높일 수 있습니다.
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With over 75 breakthrough innovations, these sequencing systems offer dry instrumentation, easier run setup, and fast secondary analysis with DRAGEN software onboard. Experience our simplest workflows yet, and perform a broad range of emerging and mid-throughput sequencing applications.
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표준 샘플에 권고하는 mRNA-Seq 워크플로우
라이브러리 프렙
Illumina 가닥 mRNA 준비
최소 25 ng의 표준(비분해) RNA를 투입하여 코딩 전사체를 분석하는 간단하고, 확장 가능하며, 비용 효과적이며 신속히 하루 안에 완료되는 솔루션입니다.
시퀀싱
NextSeq 1000 및 2000 시스템
비용 효율적이고 사용이 용이한 이 중간 수준의 처리량을 갖춘 벤치탑 시퀀서는 mRNA-Seq를 비롯하여 현재 및 새롭게 부상하는 다양한 애플리케이션을 지원합니다.
MiSeq i100 시리즈
mRNA 시퀀싱을 위한 가장 빠르고 간단한 벤치탑 시스템.
RNA 시퀀싱 방법 가이드
이 가이드는 표적 패널에서, mRNA, 전체 전사체에 이르기까지 RNA 프로파일링을 위한 Illumina 솔루션을 제공합니다. Illumina RNA 시퀀싱 워크플로우는 전사체 연구를 위해 라이브러리 프렙, 시퀀싱, 데이터 분석 단계를 원활하게 통합합니다.
가이드 다운로드RNA 라이브러리 프렙
RNA-Seq 라이브러리 프렙 기술의 발전은 전사체 연구에 혁신을 일으키고 있습니다. Illumina의 향상된 RNA 시퀀싱 라이브러리 프렙 포트폴리오는 mRNA-Seq부터 RNA-Seq 등의 다양한 시퀀싱 연구 유형에 적용 가능합니다. 이러한 솔루션은 소요 시간을 줄여주고, 다양한 연구에 유연하게 적용할 수 있으며, 규모에 따라 시퀀싱을 조정할 수 있게 해 줍니다.
RNA 라이브러리 프렙에 대해 더 알아보기포괄적인 mRNA-Seq 워크플로우
Illumina의 합성을 통한 시퀀싱(SBS) 화학 반응은 가장 널리 활용되고 있는 NGS 기술로, 전 세계 시퀀싱 데이터의 약 90%가 이 기술을 통해 생성됩니다.*
업계를 선도하는 고품질 데이터에 더해, Illumina는 라이브러리 프렙에서부터 데이터 분석 및 생물학적 해석에 이르기까지 전체 과정을 간소화하는 통합 mRNA-Seq 워크플로우를 제공합니다.
주요 mRNA 시퀀싱 관련 기사
발생생물학에서의 단일세포 분석
콜린 트랩넬 박사가 단일세포 mRNA-Seq에 대한 자신의 연구실 경험과 모든 사람이 생물정보학 도구를 사용할 수 있도록 하기 위한 노력에 대해 이야기합니다.
인터뷰 읽어 보기
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참고 문헌
- 시 L, 동 W, 수 Z, 등 Microarray scanner calibration curves: characteristics and implications. BMC 생물정보학. 2005;6 보충 2:S11.
- 나에프 F, 소치 ND, 마그나스코 M. 올리고뉴클레오타이드 어레이의 정확도 및 정밀도에 대한 연구, 고농도에서 더 많은 신호 추출. 생물정보학. 2003;19:178-184.
- 유엔 T, 웜바흐 E, 페퍼 RL, 에버르솔 BJ, 시얼폰 SC. 상업용 올리고뉴클레오타이드와 맞춤형 cDNA 마이크로어레이의 정확도와 교정. 핵산 2002;30:e48.
*데이터 산출은 기록에 기재되어 있습니다. Illumina, Inc., 2015