Illumina RNA Prep with Enrichment

광범위한 샘플의 종류 및 RNA 입력량에서 강화되고 색인된 시퀀싱 라이브러리를 생산하기 위한 빠르고 통합된 워크플로우.

< 9시간

Assay 시간

< 2시간

수작업 시간

10 ng RNA, 20 ng FFPE RNA, up to 1000 ng high-quality RNA

사용량

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

개요

Illumina RNA Prep with Enrichment는 온비드·태그멘테이션(on-bead tagmentation) 후 간소화된 90분 단일 하이브리드화 단계를 사용하여 RNA 시퀀싱(RNA-Seq) 애플리케이션을 위한 매우 빠른 솔루션을 제공합니다. 

빠르고 간단하며 확장 가능한 워크플로우

2시간 미만의 수작업 시간으로 총 9시간 이내에 시퀀싱 준비 라이브러리를 준비하고 인리치먼트할 수 있습니다. Illumina 고처리량 시퀀싱 기기와 결합하여 런당 훨씬 더 많은 샘플 수를 제공합니다.

어려운 샘플에서 고품질 데이터

포르말린 고정 파라핀 포매(FFPE) 조직 절편과 같이 제한된 출발 물질 및 손상되거나 분해된 샘플에서 재현 가능한 결과를 전달할 수 있습니다.

저렴하고 효율적인 커버리지

탁월한 캡처 효율성과 커버리지 균일성을 제공하여 시퀀싱 깊이의 일부에서 발견 능력을 극대화하고 편향 없이 정확한 검출을 위해 필요한 시퀀싱 깊이를 최소화합니다.

유연한 모듈식 패널 설계

최대 유연성을 위해 사전 구축되고 검증된 다양한 프로브 또는 맞춤형 v2 프로브 패널을 사용하여 대립유전자 특이적 발현, 융합 검출, 생체표지자 스크리닝 등과 같은 발견 연구를 지원합니다. DesignStudio 소프트웨어를 사용하여 맞춤형 프로브 패널을 설계해 보세요.

사양

필수 제품

완전한 RNA Prep with Enrichment 워크플로우에는 라이브러리 준비 키트, 프로브 패널 및 인덱스 어댑터(모든 품목은 별도로 판매됨)를 사용해야 합니다.

옵션 구성 요소는 다음과 같습니다.

  • Illumina RNA Fast Hyb Enrichment—권장된 것과 다른 plexity로 처리하는 고객을 위한 인리치먼트 시약만 해당

  • Illumina RNA Prep, (L) Tagmentation—권장되는 것과 다른 plexity로 처리하는 고객을 위한 사전 인리치먼트 시약만 해당

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애플리케이션

Illumina RNA Prep with Enrichment는 대립유전자 특이적 발현, 융합 검출, 생체표지자 스크리닝 등과 같은 검출 및 발견 연구를 지원하는 광범위한 RNA-Seq 애플리케이션을 위한 표적 시퀀싱 라이브러리를 준비하는 데 있어 샘플 유형 및 RNA 투입량의 유연성을 제공합니다.

워크플로우 예시

프로젝트 권장 사항

기기 권장 샘플 수 리드 길이
NextSeq 550 시스템

Illumina RNA Prep with Enrichment + Exome Panel 

Mid output: 5 

High output: 16 

(25M 개의 샘플당 리드 기준) 

2 × 100bp

NextSeq 1000 시스템, NextSeq 2000 시스템

Illumina RNA Prep with Enrichment + Exome Panel

P2: 16

P3: 48 

(25M 개의 샘플당 리드 기준) 

2 × 100bp

NovaSeq 6000 시스템

Illumina RNA Prep with Enrichment + Exome Panel

SP: 32

S1: 64

S2: 164 

S4: 384

(25M 개의 샘플당 리드 기준)

2 × 100bp

MiSeq 시스템

Illumina RNA Prep with Enrichment + Viral Surveillance Panel 또는 Pan-Coronavirus Panel

최대 25개의 샘플(1M 샘플당 리드 기준)

2 × 150bp

NextSeq 550 시스템

Illumina RNA Prep with Enrichment + Viral Surveillance Panel 또는 Pan-Coronavirus Panel

최대 384개의 샘플(1M 샘플당 리드 기준)

2 × 150bp

관련 애플리케이션 및 방법

문서

제품 관련 자료

비교하기

Illumina RNA Prep with Enrichment TruSeq RNA Exome Illumina 가닥 mRNA 준비
Assay 시간 < 9시간 약 2일 6.5시간
자동화 기능 리퀴드 핸들링 로봇 리퀴드 핸들링 로봇 리퀴드 핸들링 로봇
Content specifications Captures custom targets with custom v2 Oligos designed in DesignStudio assay tool or entire coding transcriptome when used with the Illumina Exome Panel 코딩 전사체/RNA 엑솜 캡처 가닥 정보가 있는 코딩 전사체 캡처
설명 포르말린 고정 파라핀 포매(FFPE) 조직 및 기타 저품질 샘플 등 광범위한 샘플의 종류와 사용량으로부터 표적 전사물(transcript) 검출 및 발견 연구를 가능하게 하는 재현 가능하고 경제적인 솔루션입니다. 정밀한 가닥 정보와 샘플 사용량 요구 사항 감소로 연구자들에게 코딩 전사체에 대한 명확하고 종합적인 관점을 제공합니다. 정밀한 가닥 정보가 있는 코딩 전사체의 분석을 위한 단순하고 비용 효율적인 솔루션입니다.
수작업 시간 < 2시간 약 11시간 < 3시간
Input quantity 10 ng RNA, 20 ng FFPE RNA, up to 1000 ng high-quality RNA 신선/냉동 샘플의 Total RNA 10 ng 또는 FFPE 샘플의 Total RNA 20 ng 표준 품질 Total RNA 25~1,000 ng
기기 NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, NextSeq 1000 시스템, NextSeq 550Dx(Research Mode), NovaSeq X 시스템, NovaSeq 6000Dx(Research Mode), NovaSeq 6000 시스템, NovaSeq X Plus 시스템, MiSeq i100 Plus 시스템, MiSeq i100 시스템 NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, NextSeq 1000 시스템, NovaSeq X 시스템, NextSeq 500 시스템, NovaSeq 6000 시스템, NovaSeq X Plus 시스템 NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, NextSeq 1000 시스템, NovaSeq X 시스템, NextSeq 500 시스템, NovaSeq 6000 시스템, NovaSeq X Plus 시스템
작용 기전 Bead-linked transposome 코딩 RNA를 표적으로 하는 바이오틴화된 캡처 프로브. 폴리A 꼬리가 있는 RNA는 필요하지 않습니다. 폴리A 포획, 라이게이션 기반 어댑터 및 인덱스 추가
방법 mRNA 시퀀싱, 표적 RNA 시퀀싱, 표적 인리치먼트 엑솜 시퀀싱, mRNA 시퀀싱 mRNA 시퀀싱
멀티플렉싱 최대 384개의 고유한 듀얼 인덱스(UDI) 최대 24개 싱글, 96개 조합(CD) 듀얼 최대 384개의 고유한 듀얼 인덱스(UDI)
핵산 종류 RNA RNA RNA
특수 샘플의 종류 사용량이 적은 샘플, FFPE 조직 사용량이 적은 샘플, FFPE 조직 FFPE 호환 불가, 사용량이 적은 샘플
종 카테고리 모든 종, 인간, 바이러스 인간 포유류, 소, 마우스, 인간, 래트
가닥 특이성 비가닥(Non-stranded) 가닥(Stranded) 가닥(Stranded)
기술 시퀀싱 시퀀싱 시퀀싱
변이 클래스 단일 염기 다형성(SNP), 유전자 융합, 전사물 변이, 단일 염기서열 변이(SNV), 삽입 결실(Indel) 단일 염기 다형성(SNP), 새로운 전사물, 전사물 변이 단일 염기 다형성(SNP), 유전자 융합, 새로운 전사물, 전사물 변이

선택 도구:

그림 자료

Fast workflow visual

Illumina RNA Prep with Enrichment는 빠른 워크플로우를 제공합니다.

온비드·태그멘테이션(on-bead tagmentation)과 90분 단일 하이브리드화 단계가 결합되어 TruSeq RNA Exome에 비해 더 적은 단계로 더 빠른 워크플로우를 제공합니다.

저사용량 샘플에서 고품질 데이터

Illumina RNA Prep with Enrichment는 UHR(Universal Human Reference)에서 10 ng 및 100 ng Total RNA의 사용량 간에 높은 데이터 일치를 달성합니다.

Detection of BCR-ABL1 gene fusion from low-input samples

저사용량 샘플에서 BCR -ABL1 gene fusion 검출

Illumina RNA Prep with Enrichment 및 Illumina Exome Panel을 사용하여 K-562 세포주에서 10 ng RNA로 준비한 라이브러리는 BCR-ABL1 유전자 융합을 성공적으로 검출했습니다. Illumina RNA Prep with Enrichment 상단 정렬 트랙은 모든 리드를 표시하고, 하단 정렬 트랙은 BCR-ABL1 융합 유전자를 지원하는 리드만 표시합니다.

Coverage of coding regions with Illumina RNA Prep with Enrichment

Illumina RNA Prep with Enrichment로 코딩 영역 커버리지

Illumina RNA Prep with Enrichment 및 Illumina Exome Panel을 사용하여 10 ng UHR RNA 및 20 ng FFPE RNA로부터 준비된 라이브러리는 coding 전사물(transcript) 및 UTR에 정렬되어 생성된 데이터의 85% 이상을 보여줍니다. 비교를 위해 TruSeq RNA Exome 라이브러리의 데이터가 표시됩니다.

저사용량 및 FFPE 샘플에서 gene fusion 검출

K-562BCR-ABL1TPM3-NTRK1DV200% 검출률. DV200

fusion(공급원) RIN RNA 사용량 검출
BCR-ABL 1 (K-562) 7.4 10 ng 6/6회 복제(100%)
TPM3-NTRK1 (결장직장암) 2.5 20 ng 6/6회 복제(100%)

리소스

비디오 및 웨비나

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소개: Illumina RNA Prep with Enrichment

이 Illumina 기술 지원 웨비나에서는 Illumina RNA Prep with Enrichment 워크플로우를 소개합니다. 이 웨비나는 고정 및 맞춤형 패널로 인리치먼트를 사용하는 표적 RNA 시퀀싱에 관심이 있는 사용자를 위해 제작되었습니다. 

축소판

RNA 시퀀싱: Illumina RNA 라이브러리 준비 워크플로우 소개

RNA 시퀀싱: Illumina의 RNA 라이브러리 준비 워크플로우 소개. 이 세션에서는 RNA 입력을 위한 샘플 준비 키트 옵션을 검토합니다.

축소판

RNA 시퀀싱: Illumina RNA Prep 프로토콜 모범 사례

이 웨비나에서는 비드 취급, 정량화 방법, 라이브러리 QC 및 문제 해결 보기에 대한 모범 사례를 다룹니다.

축소판

세포유리 RNA에서 중개 바이오마커 식별의 발전

액체 생검은 세포유리 DNA와 가장 흔히 연관되지만, 새로운 연구는 혈액 내 보다 광범위한 분석물 다양성을 조사하는 데 있어 추가적인 가치를 보여주었습니다. 세포유리 RNA(cell-free RNA, cfRNA)는 많은 조직의 동적 변화를 반영하는 것으로 입증된 이러한 분자 중 하나입니다. Illumina의 연구자들은 cfRNA의 전장 전사체 라이브러리 준비를 위한 확장 가능한 엔드투엔드 워크플로우 솔루션을 가능하게 하는 주요 변수를 최적화했습니다.

기타 리소스

custom enrichment panel v2 poster web graphic

프로브 설계부터 데이터 분석까지 다양한 표적 시퀀싱 애플리케이션을 위한 포괄적인 솔루션입니다. 맞춤형으로 설계된 패널은 GC가 풍부하고 시퀀싱이 어려운 영역에 대한 향상된 적용 범위를 제공하여 높은 균일성과 적용 범위를 보장합니다.

라이브러리 프렙 (2)

Illumina® RNA Prep with Enrichment, (L) Tagmentation (16 Samples)

20040536

16개의 라이브러리(16개의 1플렉스 인리치먼트 반응)를 준비하고 인리치먼트하기 위한 시약이 포함됩니다. 인리치먼트 프로브 패널, 정제 비드 및 인덱스 어댑터를 별도로 구매해 보세요.

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Illumina® RNA Prep with Enrichment, (L) Tagmentation (96 Samples)

20040537

96개의 라이브러리(32개의 3플렉스 인리치먼트 반응)를 준비하고 인리치먼트하기 위한 시약이 포함됩니다. 인리치먼트 프로브 패널, 정제 비드 및 인덱스 어댑터를 별도로 구매해 보세요.

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인덱스 어댑터 (4)

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091654

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개의 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10bp 인덱스가 포함됩니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091656

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10bp 인덱스가 포함됩니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091658

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10bp 인덱스가 포함됩니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091660

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10bp 인덱스가 포함됩니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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패널 (4)

Illumina Custom Enrichment Panel V2 (1536 µl, 120 bp)

20111339

Illumina Custom Enrichment Panel V2는 DesignStudio 또는 컨시어지 서비스를 사용하여 100개부터 최대 1,000,000개의 프로브까지 120 bp 이중 가닥 맞춤형 패널 설계를 지원하며 1536 µl의 재료(Illumina DNA Prep with Enrichment와 페어링했을 때 384회의 인리치먼트 반응에 충분한 양)를 제공합니다. 라이브러리 준비, 인리치먼트 및 인덱스 어댑터 시약은 별도로 주문해야 합니다.

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Discounts:

Illumina Custom Enrichment Panel V2 (384 µl, 120 bp)

20073952

Illumina Custom Enrichment Panel V2는 DesignStudio 또는 컨시어지 서비스를 사용하여 100개부터 최대 1,000,000개의 프로브까지 120 bp 이중 가닥 맞춤형 패널 설계를 지원하며 384 µl의 재료(Illumina DNA Prep with Enrichment와 페어링했을 때 96회의 인리치먼트 반응에 충분한 양)를 제공합니다. 라이브러리 준비, 인리치먼트 및 인덱스 어댑터 시약은 별도로 주문해야 합니다.

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Discounts:

Illumina Custom Enrichment Panel V2 (32 µl, 120 bp)

20073953

Illumina Custom Enrichment Panel V2는 DesignStudio 또는 컨시어지 서비스를 사용하여 100개부터 최대 1,000,000개의 프로브까지 120 bp 이중 가닥 맞춤형 패널 설계를 지원하며 32 µl의 재료(Illumina DNA Prep with Enrichment와 페어링했을 때 8회의 인리치먼트 반응에 충분한 양)를 제공합니다. 라이브러리 준비, 인리치먼트 및 인덱스 어댑터 시약은 별도로 주문해야 합니다.

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Illumina Exome Panel – Enrichment Oligos Only

20020183

Illumina DNA Prep with Enrichment와 결합 시 8개의 인리치먼트 반응, TruSeq RNA Exome과 결합 시 12개의 반응, Illumina RNA Prep with Enrichment와 결합 시 32개의 반응에 충분합니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 인덱스 어댑터를 별도로 구매해 보세요.

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서비스 (1)

Illumina RNA Library Prep with Enrichment Training

20044763

Illumina RNA Prep with Enrichment Kit에 대한 2일 온라이트 교육. 실습 교육에는 RNA 투입의 정량화뿐만 아니라 모범 사례, 문제 해결 팁 및 애플리케이션 워크플로별 Illumina 지원 분석 도구에 대한 교육이 포함됩니다.

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액세서리 제품 (2)

Illumina RNA Fast Hyb Enrichment (16 Samples)

20040540

16개의 1플렉스 인리치먼트 반응을 위한 Illumina RNA Prep with Enrichment 키트의 빠른 하이브리드화 인리치먼트 시약이 포함됩니다. 권장되는 것과 다른 plexity로 처리하는 고객을 지원합니다. 사전 인리치먼트 시약은 포함되지 않습니다. 인리치먼트를 통한 완전한 준비를 위해서는 Illumina RNA Prep with Enrichment 키트를 주문해 보세요.

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Illumina RNA Prep, (L) Tagmentation (16 Samples)

20040542

16개 라이브러리용 Illumina RNA Prep with Enrichment 키트의 사전 인리치먼트 모듈이 포함됩니다. 권장되는 것과 다른 plexity로 처리하는 고객을 지원합니다. 인리치먼트 시약 및 정제 비드는 포함되지 않습니다. 인리치먼트를 통한 완전한 준비를 위해서는 Illumina RNA Prep with Enrichment 키트를 주문해 보세요.

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선택 품목 요약

제품

수량

단가

자주 묻는 질문

Illumina는 Agilent Technologies UHR(Universal Human Reference RNA)(카탈로그 번호 740000)을 양성 대조군 샘플로 사용할 것을 권장합니다.

Illumina Exome Panel 및 Illumina Custom Enrichment Panel v2는 Illumina RNA Prep and Enrichment 키트와 함께 사용할 수 있습니다.

eBLTL은 단일하고 빠른 반응 단계에서 어댑터 태그 시퀀스를 절편화하고 추가하여 cDNA를 표지하는 인리치먼트 비드 연결 트랜스포솜입니다.

16-반응 키트는 1-plex 워크플로우를 활성화하고 96-반응 키트는 3-plex 워크플로우를 활성화합니다. 권장되는 것과 다른 plexity로 처리하기 위해 두 워크플로우에 추가 액세서리 제품을 추가할 수 있습니다.

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Illumina Custom Enrichment Panel v2

표적 맞춤형 인리치먼트 패널은 여러 표적 시퀀싱 애플리케이션에 간단하고 효율적인 솔루션을 제공합니다.

NovaSeq X 시리즈 시약 키트

NovaSeq X 시리즈용 시약 키트에는 시약 카트리지, 버퍼 카트리지, 플로우 셀, Lyo insert, 사전 로드 버퍼 및 라이브러리 튜브 스트립이 포함되어 있습니다.

MiSeq i100 Series Reagent Kits

MiSeq i100 시리즈용 시약은 사용하기 쉬운 카트리지와 유연한 시퀀싱 옵션을 위한 다중 플로우 셀 구성을 갖추었습니다.

Illumina 가닥 mRNA 준비

가닥 정보를 정밀하게 측정하여 단백질 coding 전사체를 정확하고 편향되지 않게 검출하기 위한 신속하고 비용 효과적인 워크플로우.

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