Informatics Products

DRAGEN 2차 분석

정확하고 포괄적이고 효율적인 분석

NGS 데이터를 처리하고 유전체 발견을 극대화하기 위한 바이오인포매틱스 파이프라인 제품군입니다.

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Illumina DRAGEN 소개

Illumina DRAGEN(Dynamic Read Analysis for GENomics) 2차 분석을 사용하면 규모와 분야에 관계없이 모든 규모의 랩에서 강력한 첨단 데이터 분석 도구로 유전체의 가치를 극대화할 수 있습니다. DRAGEN 2차 분석(이전 명칭, DRAGEN Bio-IT 플랫폼)은 연구 요구 사항을 충족하기 위한 여러 배포 옵션, 애플리케이션 및 파이프라인으로 정확하고 포괄적이며 매우 효율적인 바이오인포매틱스를 제공합니다. 

주요 기능 및 이점

정확한 결과

매우 정확한 결과로 자신 있게 분석해 보세요. DRAGEN은 Precision FDA Truth Challenge v2 벤치마크 데이터를 사용하여 99.84% 정확도 점수를 달성했습니다.1 

포괄적인 솔루션

최대 30개의 오픈 소스 도구를 대체할 수 있는 하나의 솔루션으로 전장 유전체, 엑솜, 메틸롬, 전사체를 분석해 보세요. 

효율적인 분석

모든 지원된 콜러로 40배 유전체를 약 34분 만에 처리해 보세요.2 DRAGEN ORA compression으로 FASTQ 파일 크기를 5배로 줄여 보세요. DRAGEN 2차 분석은 유전체 분석 속도 부문에서 두 차례 세계 기록을 세웠습니다.3,4

비용 효율성

내장된 무손실 데이터 압축으로 보관 비용 80%를 절감합니다5. 사전 구성된 워크플로우로 분석 파이프라인 개발 및 유지를 위한 시간과 비용을 절감할 수 있습니다.


멀티플랫폼 접근성

데이터와 전문 지식이 있는 곳 어디서든 만나보실 수 있습니다. DRAGEN 2차 분석은 온프레미스 서버, 클라우드 또는 직접 온보드에 탑재된 NovaSeq X 시리즈, NextSeq 1000 및 NextSeq 2000 시스템, MiSeq i100 시리즈를 통해 사용할 수 있습니다.

간소화된 통합

Illumina 시퀀싱 기기와 손쉽게 통합하여 시퀀싱부터 다운스트림 3차 분석까지 간소화된 워크플로우를 지원합니다.

배포 옵션

온프레미스 서버, 클라우드 기반 또는 기기 내 솔루션을 통해 DRAGEN을 이용해 보세요. 여러 배포 옵션으로 정확성, 속도 또는 유연성을 저하시키지 않고도 분석 요구 사항을 지원합니다. 

배포 옵션 보기

주요 분석 앱 및 파이프라인

DRAGEN

DRAGEN은 광범위한 애플리케이션을 지원하여 여러 실험 유형에 대해 하나의 솔루션으로 포괄적인 커버리지를 제공합니다. 주요 애플리케이션은 다음과 같습니다.

  • 생식세포(전장 유전체 및 인리치먼트)
  • 체세포(전장 유전체 및 인리치먼트, Tumor-only 및 tumor-normal)
  • RNA
  • 메틸화

DRAGEN은 입력 데이터 파일을 수용할 수 있고 파이프라인의 다양한 단계에서 결과 파일을 생성할 수 있는 다용도 파이프라인 세트를 포함합니다.

DRAGEN 앱 및 파이프라인 보기

DRAGEN IGG: 인구집단 규모의 변이 발견 지원

DRAGEN Iterative gVCF Genotyper(IGG)는 대규모 코호트 전반에서 소규모 생식세포 변이의 빠르고 효율적인 응집 및 유전형 분석을 가능하게 하는 인구집단 규모의 변이 분석을 위한 획기적인 솔루션을 제공합니다. 속도, 정확성 및 확장성을 위해 설계된 IGG는 증분 분석을 지원하므로 전체 데이터 세트를 재처리하지 않고도 새로운 샘플 배치를 추가할 수 있습니다.

DRAGEN IGG에 대해 더 알아보기

우리는 DRAGEN [2차] 분석을 사용하여 약 50%의 비용 절감을 실현했습니다. 계산 시간을 기준으로 하면, 수동 방법과 비교했을 때 거의 두 배의 속도입니다.

Dr Damian Kao Chief Operating Officer Basepaws
기사 읽어 보기

DRAGEN을 사용한 발전

유전 질환부터 종양학, 약리유전체학 등에 이르기까지, DRAGEN은 대다수 분야의 랩이 NGS 운영을 확장하고 판도를 바꾸는 유전체 분석을 현실로 바꾸는 데 도움을 줄 수 있습니다.

주요 리소스

DRAGEN 버전 4.3 업데이트

범유전체 기준을 사용한 멀티지놈 매핑 방법론의 진화로 상당한 정확도가 개선되었습니다.

유전체학 및 멀티오믹스 인사이트를 위한 DRAGEN

이 온디맨드 웨비나를 시청하여 혈액암 WGS 및 고형암 WGS 종양-정상의 암 연구 애플리케이션과 생식선 및 체세포 파이프라인과 구조적 변이 검출이 개선된 미세 잔존 질환(MRD)용 간소화된 파이프라인에 대해 알아보세요.

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참고 문헌

  1. Illumina. DRAGEN sets new standard for data accuracy in PrecisionFDA benchmark data. Optimizing variant calling performance with Illumina machine learning and DRAGEN graph. illumina.com/science/genomics-research/articles/dragen-shines-again-precisionfda-truth-challenge-v2.html. Accessed March 22, 2023.
  2. Illumina internal data on file, 2024. Run time calculated using DRAGEN v4.3 on DRAGEN server v4. Includes calling Full suite of callers for structural variants, repeat expansions, and targeted callers.
  3. BioIT World. Children’s Hospital of Philadelphia, Edico set world record for secondary analysis speed. bio-itworld.com/ news/2017/10/23/children-s-hospital-of-philadelphia-edico-set-world-record-for-secondary-analysis-speed. Published October 23, 2017. Accessed March 14, 2022.
  4. San Diego Union Tribune. Rady Children’s Institute sets Guinness world record. sandiegouniontribune.com/95899028-132.html. Published February 12, 2018. Accessed March 14, 2022.