작은 RNA는 유전자 침묵 및 전사 후 활성을 통해 유전자 발현을 조절하는 데 중요한 역할을 하는 짧은 비코딩 RNA입니다. 소형 RNA 시퀀싱(small RNA-Seq)은 유전자 조절, 발달 및 질병에 관여하는 마이크로RNA(miRNA) 및 기타 작은 비코딩 RNA에 대한 민감한 단일 염기 해상도 인사이트를 제공합니다. 순환 miRNA 생체표지자 탐색, miRNA 아이소형(isomiR) 특성화, 다양한 small RNA 종 프로파일링 등 어떤 작업을 하든 Illumina 시퀀싱은 샘플 유형 및 연구 설계 전반에 걸쳐 정확한 고처리량 측정을 제공합니다.
small RNA-Seq은 전통적인 mRNA 중심 시퀀싱 접근법으로 효과적으로 포착되지 않는 짧은 조절 RNA 분자에 대한 포괄적인 분석을 가능하게 합니다. 차세대 시퀀싱(next‐generation sequencing, NGS)을 활용함으로써small RNA-Seq은 다양한 샘플 유형 전반에서 small RNA 발현에 대한 편향되지 않은 관점을 제공합니다.
주요 이점은 다음과 같습니다.
miRNA-Seq은 발달, 질병 진행, 세포 경로 등에 영향을 미치는 전사 후 유전자 발현의 주요 조절인자로 기능하는 마이크로RNA의 정확한 측정에 중점을 둡니다. small RNA‐Seq 워크플로우 내에서 miRNA 시퀀싱은 miRNA 주도 규제 네트워크에 대한 심층적인 생물학적 인사이트를 가능하게 합니다.
주요 이점은 다음과 같습니다.
이 가이드는 표적 패널부터 전장 전사체에 이르기까지 RNA를 프로파일링하기 위한 솔루션을 제공합니다. Illumina RNA-Seq 워크플로우는 라이브러리 준비, 시퀀싱 및 데이터 분석을 통합하여 전사체 연구를 지원합니다.
DRAGEN 2차 분석은 정확하고 포괄적이며 효율적인 NGS 데이터 분석을 제공하는 강력한 소프트웨어 도구 제품군입니다. DRAGEN miRNA 애플리케이션은 FFPE 조직, 혈액 및 세포 배양을 포함한 다양한 샘플 유형에서 추출한 total RNA를 정확하게 정렬하고 정량화할 수 있습니다.
Illumina Connected Multiomics는 멀티오믹스 데이터를 해석하고 시각화하기 위한 강력하고 확장 가능한 분석 환경입니다. Illumina Connected Multiomics는 miRNA-Seq 데이터를 분석하여 차별적으로 발현된 miRNA를 찾고 동일한 조직에서 정량화된 차별적으로 발현된 전령 RNA와 결과를 통합할 수 있습니다. 이는 miRNA가 세포 기능의 광범위한 변화를 어떻게 유도하는지에 대한 전반적인 그림을 제공할 수 있습니다.
NGS를 사용하여 단백질체, 후성유전체, 비코딩 RNA 및 소형 RNA를 특성화하는 방법을 알아보세요.
소형 RNA 시퀀싱은 유전자 발현 및 세포 경로를 조절하는 마이크로RNA(miRNA)와 같은 짧은 비코딩 RNA 분자를 프로파일링하는 데 사용됩니다. 이는 생체표지자 발견, 질병 연구 및 기능적 유전체학에 광범위하게 적용됩니다.
소형 RNA 시퀀싱은 small RNA 종의 전체 스펙트럼을 캡처하는 반면, miRNA 시퀀싱은 miRNA에만 중점을 둡니다.
전령 RNA 시퀀싱(mRNA-Seq)은 긴 단백질 코딩 전사물을 측정하는 반면, small RNA-Seq은 전사 후 유전자 발현을 조절하는 짧은 비코딩 RNA를 표적으로 합니다. 이러한 접근법은 전체적으로 유전자 조절에 대한 상호보완적인 관점을 제공합니다.
Illumina miRNA Prep은 총 total RNA 1~500 ng에 최적화되어 있습니다.
싱글 엔드 시퀀싱은 small RNA‐Seq 및 miRNA 시퀀싱에 권장되며 정확한 정렬 및 정량화에 충분합니다. 페어드 엔드 시퀀싱은 전체 small RNA insert가 단일 리드로 캡처되므로 small RNA 라이브러리에 이점을 제공하지 않습니다.
예, 작은 RNA는 너무 작아total RNA 및 mRNA 라이브러리 준비 키트로 캡처할 수 없습니다. 이러한 작은 RNA로부터 생성된 라이브러리 단편은 비드 클린업 단계 동안 충실하게 보유되지 않습니다.
참조 자료 리소스를 통해 small RNA에 대해 자세히 알아보세요.
일반적인 유형의 small RNA에는 마이크로 RNA(miRNA), 소형 간섭 RNA(siRNA) 및 피위 상호작용 RNA(piRNA)가 포함됩니다.
RNA 시퀀싱을 통해 암 유전자 발현 및 전사체 변화를 연구하고 새로운 암 전사물을 식별합니다.
NGS 기반 프로파일링은 miRNA 전사체의 신속한 고처리량 분석을 가능하게 하며, 복잡한 질병 관련 과정 및 돌연변이 사례에 대한 통찰력을 제공할 수 있습니다.
Illumina는 후성유전학적 변형 및 유전자 조절 연구에 관심이 있는 연구자들에게 광범위한 후성유전학 도구 포트폴리오를 제공합니다.
이 연구는 전사체 전반 RNA‐Seq이 긴 비코딩 RNA의 규제 복잡성을 밝혀내고 암 및 질병 연구에서 RNA 기반 통찰력의 중요성을 강조하는 방법을 보여줍니다.
Illumina 바이오인포매틱스 도구를 사용하면 대량의 복잡한 유전체 데이터를 쉽게 관리, 분석 및 해석할 수 있습니다.
이 기사는 다양한 RNA-Seq 실험 유형에 대한 고려 사항을 검토하고 연구 설계에 도움이 되는 리소스를 제공합니다.
전문가에게 문의하여 small RNA-Seq 솔루션에 대해 자세히 알아보세요.