NovaSeq 6000 Sequencing System 사양

Powerful performance at hand

조정 가능한 데이터 아웃풋과 함께 확장 가능한 고처리량 시퀀싱

NovaSeq 6000 system render

리드 길이에 따른 플로우 셀 출력^a

리드 길이(read length)	SP	S1	S2	S4
1 × 35 bp	해당 없음	해당 없음	해당 없음	280~350 Gb
2 × 50 bp	65~80 Gb	134~167 Gb	333~417 Gb	해당 없음
2 × 100 bp	134~167 Gb	266~333 Gb	667~833 Gb	1600~2000 Gb
2 × 150 bp	200~250 Gb	400~500 Gb	1000~1250 Gb	2400~3000 Gb
2 × 250 bp^b	325~400 Gb	해당 없음	해당 없음	해당 없음

a. 지원되는 클러스터 밀도에서 Illumina PhiX Control 라이브러리를 기반으로 한 데이터 아웃풋 사양. NovaSeq 6000 시스템은 싱글 플로우 셀 런 또는 듀얼 플로우 셀 런이 가능합니다. 듀얼 플로우 셀 런은 위에 나열된 데이터 아웃풋의 두 배를 제공합니다.

b. 최대 리드 길이.

주요 애플리케이션별 예상 샘플 처리량^a

신청	SP	S1	S2	S4
런당 인간 유전체(genome) 수	약 4개	약 8개	약 20개	약 48개
런당 엑솜 수	약 40개	약 80개	약 200개	약 500개
런당 전사체 수	약 32개	약 64개	약 164개	약 400개

a. 모든 샘플 처리량은 예상 수치이며 듀얼 플로우 셀을 이용한 런을 기준으로 함. 인간 유전체(genome)에 대한 추정치는 30x 유전체 커버리지(coverage)를 달성하기 위해 샘플당 > 120 Gb의 데이터를 가정하여 도출됨. 엑솜에 대한 추정치는 약 8 Gb/100x를 가정하여 도출됨. 전사체에 대한 추정치는 ≥ 50M 개의 리드를 가정하여 도출됨. 처리량은 사용된 Library Preparation Kit에 따라 상이할 수 있음.

플로우 셀당 필터 통과 리드^a

리드 유형	SP	S1	S2	S4
싱글 엔드 리드(single-end reads)	650~800M	1.3~1.6B	3.3~4.1B	8~10B
페어드 엔드 리드	1.3~1.6B	2.6~3.2B	6.6~8.2B	16~20B

a. 모든 샘플 처리량은 예상 수치이며 듀얼 플로우 셀을 이용한 런을 기준으로 함. 인간 유전체(genome)에 대한 추정치는 30x 유전체 커버리지(coverage)를 달성하기 위해 샘플당 > 120 Gb의 데이터를 가정하여 도출됨. 엑솜에 대한 추정치는 약 8 Gb/100x를 가정하여 도출됨. 전사체에 대한 추정치는 ≥ 50M 개의 리드를 가정하여 도출됨. 처리량은 사용된 Library Preparation Kit에 따라 상이할 수 있음.

Q-Score^a

리드 길이(read length)	SP	S1	S2	S4
1 × 35 bp	해당 없음	해당 없음	해당 없음	Q30 이상의 염기 ≥ 90%
2 × 50 bp	Q30 이상의 염기 ≥ 90%			해당 없음
2 × 100 bp	Q30을 넘는 염기의 ≥ 85%
2 × 150 bp	Q30을 넘는 염기의 ≥ 85%
2 × 250 bp	Q30을 넘는 염기의 ≥ 75%	해당 없음	해당 없음	해당 없음

a. Q-Score는 NovaSeq 6000 Reagent Kits v1.5에서 Illumina PhiX Control 라이브러리 사용을 기준으로 함.

런 타임^a

리드 길이(read length)	SP	S1	S2	S4
1 × 35 bp	해당 없음	해당 없음	해당 없음	약 14시간
2 × 50 bp	약 13시간	약 13시간	약 16시간	해당 없음
2 × 100 bp	약 19시간	약 19시간	약 25시간	약 36시간
2 × 150 bp	약 25시간	약 25시간	약 36시간	약 44시간
2 × 250 bp	약 38시간	해당 없음	해당 없음	해당 없음

a. Illumina PhiX Control 라이브러리를 사용하여 NovaSeq 6000 Reagents 키트 v1.5를 기반으로 한 런 타임이며 동시에 2개의 플로우 셀을 런(run)합니다.

기기 사양

NovaSeq 6000 system specifications

NovaSeq 6000 기기 사양

기기 구성

컴퓨터 및 터치스크린 디스플레이 설치 설정 및 액세서리 데이터 수집 및 분석 소프트웨어
기기 제어 컴퓨터
참고: 컴퓨터 구성은 정기적으로 업그레이드됩니다. 현재 구성에 대해서는 현지 고객 관리자에게 문의해 주세요.

베이스 유닛: Portwell WADE-8022(Intel i7 4700EQ CPU 탑재)

메모리: 2 × 8 GB DDR3L SODIMM

하드 드라이브: 없음

SSD: 256 GB mSATA

운영체제(OS): Windows 10
운영 환경
실내 전용

온도: 19°C~25°C(22°C ±3°C),<2 °C change per hour

습도: 비응축 상대 습도 20~80%

고도: 2000미터(6500피트) 미만

환기: 최대 8530BTU/h 및 평균 6000BTU/h
레이저
파장

532 nm, 660 nm, 780 nm, 790 nm
모니터를 사용한 치수
W × D × H

80.0 cm × 94.5 cm × 165.6 cm
(31.5 in × 37.2 in × 65.2 in)
무게

481 kg(1059 lb)
드립 트레이 3.5 kg(7.8 lb), 키보드 및 마우스 0.9 kg(2 lb) 포함
패키지 규격
W × D × H

92 cm × 120 cm × 118 cm
패키지 무게

628 kg(1385 lb)
전력 요구 사항

200~240 VAC 50/60 Hz, 16 A , 단상, 2500 W Illumina는 지역별 무정전 전원 공급 장치 제공
네트워크 연결

기기와 데이터 관리 시스템 간에 1 Gb 전용 연결. 직접 연결 또는 네트워크를 통해 연결
네트워크 연결 대역폭

내부 네트워크 업로드: 200 Mbps/기기

BaseSpace Sequence Hub 업로드: 200 Mbps/기기

기기 운영 데이터 업로드: 5 Mbps/기기

상세 사양 설명서(PDF) 보기

주요 기술

Sequencing by Synthesis(SBS) 기술

NovaSeq 6000 시스템 입증된 Illumina 시퀀싱 by synthesis(SBS) 기술을 활용하여 정확한 데이터와 견고한 성능을 제공합니다. SBS chemistry는 가역적 종결자(reversible terminator) 형광 표지된 뉴클레오티드를 사용합니다. 이 방법은 성장하는 DNA 가닥에 통합될 때 단일 염기를 감지하여 수십억 개의 시퀀스를 동시에 리드합니다.

패턴화된 플로우 셀 기술

NovaSeq 6000 시스템은 패턴화된 플로우 셀 기술을 통합하여 한층 더 많은 양의 데이터를 처리하므로 다양한 시퀀싱 애플리케이션에 이용할 수 있습니다. 패턴화된 플로우 셀은 정해진 위치에 수십억 개의 나노웰(nanowell)을 가지고 있으며, 시퀀싱 클러스터의 간격이 균일하게 설계되어 있습니다. 이를 통해 시스템의 시퀀싱 리드 및 전체 데이터 생산량이 크게 증가합니다.