암 후성유전학 연구 방법으로 종양 형성 경로 및 암 진행에 대한 인사이트 제공
암은 유전체와 관련된 질병이지만 유전자 돌연변이는 그 중 하나의 요인에 불과합니다. 비유전적 변화도 표현형에 영향을 미칩니다. 암의 후성유전학 환경을 이해하는 것은 암의 시작, 진행 및 치료 반응을 모델링하는 데 점점 더 중요해지고 있습니다. 암 후성유전학 연구는 세포가 DNA 메틸레이션과 같은 과정을 통해 유전자 활성을 제어하는 방법을 밝혀낼 수 있습니다.
후성유전체학 기술은 암 유전자 또는 약물 내성의 조절과 관련된 세포 생체표지자를 식별할 수 있습니다.
메틸레이션 시퀀싱은 암의 후성유전학적 변화를 연구하기 위한 강력한 접근법을 제공하여 유전자 조절 및 종양 진행에 영향을 미치는 DNA 메틸레이션 패턴의 단일 염기 해상도를 제공합니다. 연구자들은 차세대 시퀀싱(next-generation sequencing, NGS)을 사용하여 종양발생과 관련된 메틸레이션 이벤트를 프로파일링할 수 있습니다. 특정 방법은 단일 워크플로우에서 유전적 변이와 메틸레이션 패턴을 모두 검출할 수 있으므로, 체세포 돌연변이와 비정상적인 메틸레이션 시그니처를 식별하는 데 중요한 동시 유전체 및 후성유전체 인사이트를 얻을 수 있습니다.
다음 사항에 대해 더 알아보세요.
전장 유전체 메틸레이션 시퀀싱으로 유전체 전반의 시토신에서 메틸레이션 검출
인핸서 및 전사 인자 결합 부위를 포함한 새로운 관심 영역 캡처
최소한의 DNA 투입만 필요하므로 액체 생검과 같은 암 샘플에 적합
비침습적 암 검출 및 모니터링 연구를 위한 무세포 DNA(cfDNA) 샘플 분석 가능
메틸레이션 어레이를 사용하면 연구자들이 단일 부위 해상도로 암세포의 후성유전체 전반에서 메틸레이션을 정량적으로 조사할 수 있습니다. 어레이 기반 메틸레이션 프로파일링은 CpG 섬, 선별된 CHH 부위, 인핸서, 개방 염색질 영역 및 전사 인자 결합 부위에 대한 매우 정확하고 표적적인 조사를 제공합니다.* 고처리량 연구 방법으로서 어레이는 대체품에 비해 샘플당 비용이 낮습니다.
메틸레이션 어레이 프로토콜은 > 98%의 assay 재현성과 포르말린 고정 파라핀 포매(FFPE) 샘플에 대한 지원을 통해 사용자 친화적이고 간소화된 워크플로우를 제공하여 바이오뱅크 조직에 메틸레이션 어레이의 적용 가능성을 높입니다.
*CpG: 시토신이 구아닌에 의해 직접 이어지는 유전체 영역; CHH: 메틸레이션이 발생할 수 있는 기타 유전체 영역. 이는 시토신에 의해 정의되며 구아닌 이외의 뉴클레오티드(H = A, T 또는 C)가 바로 뒤따릅니다.
비용 효율적인 메틸레이션 프로파일링 제공
표적 부위에서 매우 정밀한 메틸레이션 측정 제공
확장성이 뛰어난 샘플 처리 지원
낮은 컴퓨팅 부담으로 간단한 데이터 분석 제공
암 연구자들은 전위효소 접근 가능 염색질 및 시퀀싱(transposase-accessible chromatin with sequencing,ATAC-Seq) assay을 사용하여 조절 요소에 대한 사전 지식 없이 유전체 전반에서 후성유전학적 특성을 연구할 수 있습니다. ATAC-Seq는 genomic DNA를 열린 크로마틴 부위에 우선적으로 삽입하고 시퀀싱 프라이머를 첨가하는 고활성 전위효소인 Tn5에 노출시킵니다. 유전체 또는 전사체 프로파일링을 포함할 수 있는 후속 NGS 분석은 유전체 전반의 염색질 접근성에 대한 통찰력을 제공합니다.
편향되지 않은 발견을 위한 사전 정의된 표적 없이 유전체 전반에서 오픈 크로마틴 발견
FAIRE-Seq 및 DNase-Seq
간소화된 워크플로우로 신속한 결과 도출
개방형 크로마틴의 영역이 발현되고 있는지 직접 확인할 수 있는 RNA-Seq 연구를 보완합니다.
chromatin immunoprecipitation sequencing(ChIP-Seq)은 전사 인자 및 기타 단백질의 유전체 전체 DNA 결합 부위를 식별하는 강력한 방법입니다. 이 방법으로 일부 암의 발생과 진행에 중요한 역할을 하는 유전자 조절 사건 및 생물학적 경로에 대한 인사이트를 도출할 수 있습니다. Illumina는 ChIP-Seq을 사용하여 유전자 조절에 대한 유전체 전반의 조사를 가능하게 하는 효율적인 워크플로우 솔루션을 제공합니다.
유전체 전반에서 전사 인자 또는 히스톤 변형에 대한 DNA 표적을 포착합니다.
전사 인자 결합 부위 정의
RNA-Seq 및 메틸레이션 분석과 결합 시 유전자 조절 네트워크 밝혀짐
다양한 사용량 DNA 샘플과의 호환성 제공
Cancer Research Methods Guide
이 방법 가이드에서 Illumina 시퀀싱에 대한 개요와 인기 있는 암 연구 방법에 대한 워크플로우 제안을 알아보세요.
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5-base 분석으로 복잡한 경로를 디코딩하여 멀티오믹스 인사이트 확보
이 eBook에서, 유전 질환, 암 및 기타 복합 질환의 메커니즘을 파악하기 위해 메틸롬과 유전체를 함께 연구하는 것의 가치를 살펴보세요.
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액체 생검 eBook
20페이지가 넘는 이 eBook은 NGS과 마이크로어레이를 사용하여 액체 생검 샘플의 특성을 철저하게 확인하기 위한 포괄적인 워크플로우를 제시합니다.
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CpG 섬, 유전자, 인핸서(enhancer) 등 폭넓은 커버리지를 제공하는 강력한 메틸레이션 프로파일링 마이크로어레이(microarray)입니다. 유전 및 희귀 질환 연구, 암 연구 및 분류에 이상적입니다.
5-염기 유전체(A, T, G, C, 5mC)를 포괄적으로 발견하기 위한 단일 분석으로, 전체 유전체 및 메틸롬에 대한 이중 인사이트를 제공합니다.
5개의 DNA 염기(A, T, G, C, 5mC)의 표적 검출을 위한 단일 분석으로 유전체 변이 및 메틸레이션 이벤트에 대한 이중 인사이트를 제공합니다.
후성유전학에 대한 이 인포그래픽은 비유전학적 변화가 암에 대한 이해에 큰 영향을 미치는 이유를 알아보기 위한 시각적 가이드 역할을 합니다.
메틸레이션 마이크로어레이를 통한 암 생물학 이해
이 비디오에서 암 생물학 전문가들은 생체의학 연구를 위해 메틸레이션 마이크로어레이를 활용하는 것의 많은 장점에 대해 논의합니다.
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이 비디오에서는 멀티오믹스를 통해 복잡한 표현형의 원인과 결과를 연결하여 이전에는 불가능했던 발견을 가능하게 하는 방법을 알아보세요.
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