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NextSeq 1000/2000系统的规格

提高当前的测序效率,备以今后的规模需求

查看NextSeq 1000和2000测序系统的规格,从零开始重新设计,满足不断发展的需求

每个流动槽的测序产出*

NextSeq 1000和NextSeq 2000
流动槽类型 P1 P2 P3
1 × 50 bp     60 Gb
2 × 50 bp   40 Gb 120 Gb
2 × 100 bp   80 Gb 240 Gb
2 × 150 bp 30 Gb 120 Gb 360 Gb

* 输出规格基于单个流动槽,使用Illumina PhiX对照文库,在支持的簇密度下产出进行计算。
† P3试剂仅适用于NextSeq 2000。

每个流动槽通过过滤的read

NextSeq 1000和NextSeq 2000
流动槽类型 P1 P2 P3 *
单端Reads 100 M 400 M 1.2 B
双端Reads 200 M 800 M 2.4 B

* P3试剂仅适用于NextSeq 2000。

质量分值*和运行时间

NextSeq 1000和NextSeq 2000
流动槽类型 P1 P2 P3
质量分值  
1 × 50 bp 在1 × 50 bp时,≥ 90%的碱基分值高于Q30
2 × 50 bp 在2 × 50 bp时,≥ 90%的碱基分值高于Q30
2 × 100 bp 在2 × 100 bp时,≥ 85%的碱基分值高于Q30
2 × 150 bp 在2 × 150 bp时,≥ 85%的碱基分值高于Q30
运行时间  
1 × 50 bp     约11小时
2 × 50 bp   约13小时 约19小时
2 × 100 bp   约21小时 约33小时
2 × 150 bp 约19小时 约29小时 约48小时

* 质量分值(Q值)是对碱基检出中错误发生几率的预测。>Q30的碱基百分比根据整个运行中的数据取平均值。质量分值是基于NextSeq试剂盒在NextSeq 1000和2000系统上的运行所计算的,利用了Illumina PhiX对照文库。根据文库类型和质量、插入片段大小、上样浓度及其他实验因素的不同,性能可能有所差异。
† 运行时间包括NextSeq 1000或NextSeq 2000系统上的簇生成、测序和碱基检出。
‡ P3试剂仅适用于NextSeq 2000。

对关键应用估计的样本通量

NextSeq 1000和NextSeq 2000
流动槽类型 P1 P2 P3 *
小型全基因组测序(300个循环)
130 Mb基因组; 覆盖度大于30倍
~7 ~30 ~90
全外显子组测序(200个循环)
平均目标区域覆盖度为50倍; 90%的目标区域覆盖度为20倍
~4 ~16 ~48
单细胞RNA-Seq(100个循环)
4K细胞, 10k-50k reads/细胞
  ~2-10 ~6-30
miRNA-Seq或小RNA分析(50个循环)
每个样本11M read
    ~108

* P3试剂仅适用于NextSeq 2000。
† 单细胞RNA-Seq的推荐测序深度在很大程度上取决于样本类型和实验目标,需要针对每项研究进行优化。

 

 

NextSeq 1000和NextSeq 2000
规格

仪器配置
  • 内含独立试剂的干式仪器,整合了DRAGEN Bio-IT FPGA二级分析
    仪器控制计算机
    • 主机:仪器内置的2U微型服务器
    • 内存:288 GB
    • 硬盘:3.8 TB SSD
    • 操作系统:Linux CentOS 7.6
    操作环境
    • 温度:15°C-30°C
    • 湿度:相对湿度20%–80%,非冷凝
    • 海拔:0–2000米
    • 仅供室内使用
    激光
    • 波长:449 nm、523 nm、820 nm
    • 安全性:1级激光产品
    尺寸
    • 宽x深x高:60 cmx65 cmx60 cm
    • 重量:141 kg
    运输箱尺寸
    • 运输箱宽x深x高:92 cmx120 cmx118 cm
    • 毛重:232 kg
    电源要求
    • 仪器输入电压:100 V到240 V交流电
    • 仪器输入频率:50/60 Hz
    网络连接带宽
    • 内部网络上传速度:200 Mb/s/仪器
    • BaseSpace Sequence Hub上传速度:200 Mb/s/仪器
    • 仪器操作数据上传速度:5 Mb/s/仪器
    产品安全与合规
    • NRTL认证IEC
    • 61010-1 CE认证
    • FCC/IC批准
  • 下载规格(PDF)
nextseq 2000 system drawing

 

 

NextSeq 1000和NextSeq 2000
卡盒

基于卡盒的易用平台

The NextSeq 1000和NextSeq 2000测序系统利用了一种集成式卡盒,包括试剂、流体和废液容器,简化了文库上样和测序的操作。操作过程非常简单,只需解冻试剂卡盒,将流动槽插入卡盒,然后把文库加到卡盒中,最后将组装好的卡盒插入仪器。

NextSeq 1000和NextSeq 2000
流动槽

更高的产出

为了充分利用这些高密度流动槽, NextSeq 1000和NextSeq 2000测序系统专门配备了新型超高分辨率光学系统,与传统台式系统相比,该系统可生成分辨率和灵敏度更高的成像数据。微型化造就了可扩展的弹性通量,并且其数据质量与当前的NextSeq 550系统保持了相同的高标准。

NextSeq 2000 Cartidge
NextSeq 2000 Flow Cell

NextSeq 1000 and NextSeq 2000
Flow Cell

Increased output

To take full advantage of higher density flow cells, the NextSeq 1000 and NextSeq 2000 Sequencing Systems feature a novel super resolution optics system that yields highly accurate imaging data with greater resolution and higher sensitivity than traditional benchtop systems. This miniaturization provides scalability for a variety of output quantities while maintaining the same high standards of data quality enjoyed by NextSeq 550 System users today.

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