让文库制备的流程自动化

高通量文库制备自动化

Sage Science
Pippin Prep和BluePippin:自动化DNA片段大小选择
  • 消除可变干扰且经济高效,节省了手动凝胶所需的时间,是一款高性价比上样即运行的高产自动化片段选择系统
  • 每次运行最多分离5个样本,并可使用Pippin Prep(从50到1.5k个碱基)和BluePippin(最多从50 Kb环化配对文库)收集靶点
  • 提供更可靠精确的片段大小调整信息,从而提高基因组组装质量
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自动化文库制备工作流程

测序文库制备的自动化可最大限度地减少错误,减少手工操作的时间,并实现更高的通量。Illumina通过与液体处理、片段化和片段选择方面的领先自动化供应商合作,让新一代测序(NGS)试剂盒的自动化更容易实现。如此产生的解决方案,如下所述,极大地降低了方法开发与优化的时间和成本。

自动化的液体处理    

对于试图提高通量和一致性的实验室而言,液体处理机器人是重要的工具。Illumina的文库制备试剂盒可在大多数通用型液体处理机器人上实现自动化。

大多数行业领先的供应商为我们的试剂盒设计了自动化方案,这些自动化方案极大地减少了方法开发所消耗的时间和精力。“Illumina Qualified” 的认证表示Illumina已证实此自动方法制备的文库与手动制备的文库相当。

点选以下商标以显示该供应商所能提供的自动化方法:

文库制备自动化用户指南

了解当评估文库制备自动化系统时需考虑的问题。

阅读指南
Agilent Technologies
Beckman Coulter
Eppendorf
Hamilton Robotics
Perkin Elmer
Tecan
Agilent Technologies

Science for Life Laboratories is working with Illumina to develop methods for various Library Prep workflows. Methods and associated documentation are available on GitHub.

Website GitHub Repository

Available Automated Methods Liquid Handling Platforms
Kit Source Illumina Qualified Docs  
TruSeq Stranded Total RNA Other   Bravo Option B
TruSeq RNA Access Other   Bravo Option B
TruSeq Nano DNA Other   Bravo Option B
Nextera XT DNA Other   Bravo Option B
Nextera Rapid Capture Exome Other   Bravo Option B
TruSeq Stranded mRNA Other   Bravo Option B
TruSeq DNA PCR-Free Other   Bravo Option B

Beckman Coulter

Biomek Liquid Handler — 强大的系统,具有出色的灵活性,可制备各级别通量的自动化文库。业内领先的软件,可创建易于使用的预编程解决方案,以处理文库构建、DNA纯化和大小选择、qPCR设置、标准化和混合等必要步骤。对于高通量处理,Biomek FXP Dual Muilti-96 and Span 8 系统可凭借单一系统上的组合全板及单孔的处理最大限度提高通量和效率。

网站   电话:1-800-732-2345

可用的自动化方法 液体处理平台
试剂盒 来源 经过Illumina授权 文档  
TruSeq RNA Access 供应商   Biomek FXp
Nextera快速捕获外显子组 供应商 Biomek FXp
Nextera XT DNA 供应商 Biomek FXp
TruSeq Nano DNA 供应商   Biomek FXp
TruSeq DNA无PCR 供应商 Biomek FXp
TruSeq链式总RNA 供应商 Biomek FXp
TruSeq链式mRNA 供应商 Biomek FXp
TruSeq RNA v2 供应商   Biomek FXp
TruSight HLA 供应商 Biomek FXp;Biomek NX

Eppendorf

Eppendorf epMotion自动化移液系统产品系列因其准确性、重复性和易用性而闻名。提供多种方案,例如手柄运输、真空站、集成式混合器、板温度控制等;优化epMotion系统以适应实验室日常工作,例如文库制备、PCR设置、DNA/RNA纯化、微珠分析,甚至细胞处理。

网站  电子邮件  联系方式

可用的自动化方法 液体处理平台
试剂盒 来源 经过Illumina授权 文档  
TruSeq Nano DNA 供应商 epMotion 5075
Nextera快速捕获外显子组 供应商   epMotion 5075
TruSeq链式总RNA 供应商 epMotion 5075
TruSeq链式mRNA 供应商 epMotion 5075
TruSeq DNA无PCR 供应商 epMotion 5075

Hamilton Robotics

Hamilton Robotics是液体处理设备和实验室自动化技术领域的领导者,以提供可靠性、高性能和灵活性推动生命科学和生物技术的发展而闻名。Hamilton已与Illumina携手合作,联合开发标准文库制备自动化解决方案。Hamilton的平台包括Microlab® NIMBUS — 同类首个紧凑型高速个人化移液工作站;Microlab STAR — Hamilton销量最高的自动化移液平台;以及Hamilton VANTAGE — 最新的垂直整合型液体处理器。

网站  电子邮件  电话:1-800-648-5950

可用的自动化方法 液体处理平台
试剂盒 来源 经过Illumina授权 文档  
TruSeq RNA Access 供应商 STAR
TruSeq Nano DNA 供应商 STAR
TruSeq链式总RNA 供应商 STAR
TruSeq链式mRNA 供应商 STAR
TruSeq DNA无PCR 供应商     STAR
TruSeq定制扩增子试剂盒v1.5 供应商 STAR
Nextera XT DNA 供应商     STAR
16S rRNA 供应商     STAR

PerkinElmer

PerkinElmer的文库制备自动化解决方案可消除当今测序技术存在的处理瓶颈。我们的自动化及微流控平台可让科学家从头至尾都能以一种用户友好且易于实施的方式来处理样本。设有预先经过验证的操作流程的标准化硬件配置,以及用于测量核酸样本基本特征的仪器,为动态变化的应用及样本制备化学反应提供了所需的灵活性及质量控制。PerkinElmer的文库制备仪器得到专门组建且知识渊博的应用团队的全面支持,该团队会提供全面的仪器培训及日常支持。

网站  电子邮件

可用的自动化方法 液体处理平台
试剂盒 来源 经过Illumina授权 文档  
TruSeq外显子组 供应商     Sciclone
TruSeq RNA Access 供应商   Sciclone NGS和NGSx
TruSeq Nano DNA 供应商 Sciclone NGS和NGSx
TruSeq DNA无PCR 供应商 Sciclone NGS和NGSx
TruSeq链式总RNA 供应商 Sciclone NGS和NGSx
TruSeq链式mRNA 供应商 Sciclone NGS和NGSx
TruSeq RNA v2 供应商   Sciclone NGS和NGSx
Nextera 供应商   NGS Express
TruSeq定制扩增子试剂盒v1.5 供应商     Zephyr NGS
Nextera XT DNA 供应商   Sciclone
Nextera快速捕获外显子组 供应商 Sciclone

Tecan

Tecan Freedom EVO®平台提供当今最灵活的移液平台,您可以使用其中的工具自动进行实验室研究。另外,我们还提供了大量针对特定应用(包括测序文库制备)的标准化工具包。

网站  电子邮件

可用的自动化方法 液体处理平台
试剂盒 来源 经过Illumina授权 文档  
TruSeq Nano DNA 供应商   Freedom EVO NGS
TruSeq定制扩增子试剂盒v1.5 供应商   Freedom EVO NGS
TruSeq链式mRNA 供应商 Freedom EVO NGS
Nextera快速捕获外显子组 供应商 Freedom EVO NGS
TruSeq链式总RNA 供应商   Freedom EVO NGS
TruSeq DNA无PCR 供应商   Freedom EVO NGS
Nextera XT DNA 供应商   Freedom EVO NGS

尽管我们会竭尽所能将此列表保持更新,但若要获取最新详细信息,请联系供应商。
注意:所有商标均为其各自所有者的财产。

片段化和大小选择既费时,又费力。Advanced Analytical、Covaris、PerkinElmer和Sage都提供了更为轻松的解决方案,使我们的客户能够将这些步骤自动化。关于Covaris的剪切系统,我们的用户指南中也包含了建议的仪器设置。

关于我们的合作伙伴所提供的不同文库制备自动化方案,请阅读下文。

Available Library Prep Automation Methods
高级分析
Fragment Analyzer:NGS文库、基因组DNA和RNA的定性与定量分析
  • 2014 Frost & Sullivan新产品创新奖
  • 自动化:自动按批次分析(每批12或96个样本)多达288个样本
  • 高灵敏度:检测峰值低于5 pg/µl,弥散带(smear)低至50 pg/µl
  • 广泛的大小范围:分析DNA的大小范围从10 bp到40,000 bp不等
  • 可靠操作:快速设置、高速运行时间、极低故障率
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Covaris
Covaris M220:文库制备简单快捷 — 在单一样本形式下“单击并剪切”
  • 快速:处理样本的准备时间不到2分钟
  • 简单:直观的操作,无需培训
  • 低温:集成温度控制,无需使用冰块或额外的冷却器
  • 通用性:选择片段分布的范围在150 bp到5 kb之间
  • 安静:可在实验室的任何地方使用
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Covaris
Covaris S220:单一样本形式下的通用DNA剪切
  • S220 Focused-ultrasonicator是一种通用的高功率系统,专为DNA剪切及其他预分析的样本处理应用而设计
  • S220 在单一样本模式下精准控制从25 µl到10 ml样本量的能量配比
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Covaris
Covaris E220: Multi-sample DNA shearing in a batch-processing format
  • The E220 Focused-ultrasonicator enables multi-sample, batch preparation, processing a wide range of sample types and volumes, fragmenting 1 to 96 samples in a single batch
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Perkin Elmer
LabChip GX Touch:NGS文库、基因组DNA及RNA的整体评估及定量
  • 自动化:可自动分析多达384个样本
  • 灵活性:直接从96孔或384孔板中挑选出样本孔
  • 快速分析:每个样本孔30秒内便可产生样本数据
  • 样本强度指标:同时为RNA和gDNA提供自动化样本质量评分
  • 节约样本需求:每次分析仅使用2 µl的样本
  • 全面的实验分析方法选择:可从标准DNA或RNA、高灵敏DNA、基因组DNA及小RNA中进行选择
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Perkin Elmer
LabChip XT:自动化DNA片段大小选择
  • 快速、可再现、高分辨率的DNA片段选择,低于30分钟的处理速度
  • 定量、数字化数据
  • 干电极接触及独立通道极大地降低了交叉污染的可能性
  • 能够回收未分离的样本并能从每个样本收集到多个片段
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NeoPrep文库制备系统
NeoPrep文库制备系统

执行自动化文库制备。每次运行最多产生16个文库,只需30分钟的手动操作时间。

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多重测序分析
多重测序分析

在一次测序运行期间混合并测序大量文库。

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HiSeq 3000/HiSeq 4000系统
HiSeq 3000/HiSeq 4000系统

这些测序仪能在多个应用间以最低的单样本成本提供最高的单日通量。

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自动化文库制备买家指南
自动化文库制备买家指南

了解评估NGS文库制备自动化系统时的注意事项。

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