小型生物体概述

微生物基因组测序有助于公共安全、流行病学和疾病监测方面的研究

小规模全基因组测序

小型基因组测序(≤ 5 Mb)是指对细菌、病毒或其他微生物的完整基因组进行测序,然后将序列与已知的参考序列比较。小型微生物基因组测序适用于公共卫生食品检测、感染性疾病监测、分子流行病学研究和环境宏基因组学领域。

快速、免培养的微生物分析
  • 可对来自单一生物体培养的所有基因进行研究
  • 可同时对数千个生物体进行测序
  • 可对微生物或病毒基因组进行全面分析
  • 通过提供来自同源染色体的不同基因信息,可帮助发现微生物或病毒样本中的新生物标志物,并支持单体型分析

小型基因组测序研究采用了不同于传统方法的新一代测序(NGS),省去了需要花费大量人工克隆步骤。借助NGS,生物学家们还可以通过多重分析对数百个生物体同时测序。NGS可以识别频率较低的变异、基因组重组,以及在使用其他方法的情况下容易漏识别或由于成本太高而不便识别的其他基因变化。对于小型基因组,进行DNA文库制备、测序和分析的时间仅为2天。

Illumina边合成边测序(SBS)化学反应是应用最广的NGS技术,生成的测序数据量约占全球90%。*

Illumina不仅提供业内领先的数据质量,还提供集成式工作流程,实现了从文库制备到数据分析的小型基因组测序简化流程。

单击下面的 可查看每个工作流程步骤的产品。

Nextera XT DNA文库制备试剂盒

适用于小型基因组、PCR扩增子和质粒的文库制备工作流程,既简单又快速。

Nextera环化配对文库制备试剂盒

提供基于低DNA输入制备环化配对文库以供测序的方法,产品分无凝胶和带凝胶两种。

MiSeq系统

快速简单,适合靶向测序和小型基因组测序,每次运行可处理多达384个小型基因组。

NextSeq 500系统

支持多应用的灵活桌面式测序仪,每次运行可实现多达384个小型基因组测序。

平台比较工具

比较各个测序平台,找出最适合您的实验室和应用程序的系统。

测序试剂

查找每个Illumina测序系统的专用试剂盒,其中包含测序试剂、流动槽和/或缓冲液。

BWA全基因组测序应用程序

使用BWA比对和GATK变异检出,可处理全基因组测序数据。

Isaac全基因组测序应用程序

使用Isaac比对和变异检出,可快速从全基因组序列中提取生物信息。

SPAdes Genome Assembler

适合单细胞和孤立基因组的从头组装软件。

BaseSpace Cloud或Onsite

Illumina的基因组学计算环境,适合NGS数据分析和管理。

微生物测序
微生物测序

微生物全基因组测序是一种测定新生物体的基因组信息、完成已知生物体的基因组或比较多个样本基因组的重要研究工具。了解微生物全基因组测序的更多信息

鸟枪法宏基因组学
鸟枪法宏基因组学

借助鸟枪法宏基因组学,可对所给复杂样本中存在的所有生物体的所有基因进行全面分析。研究人员可以通过它检测到在使用其他方法的情况下容易漏识别或由于成本太高而不便识别的丰度很低的微生物。了解微生物宏基因组测序的更多信息

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*存档数据计算。Illumina, Inc., 2015