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Illumina在线技术培训研讨会 — RNA Sequencing Part I: Introduction

RNA测序 (RNA-seq) 是一种高度灵敏而准确地在转录组层面衡量表达的工具,它可以在不同的疾病状态下、不同疗法的响应下、不同的环境条件下以及范围更广泛的其他研究中对以前未检测到的变化提供一种可见性。由于RNA测序产品的多样性及应用的广泛性,我们近期将分四个部分来介绍RNA测序产品的基本操作流程,试剂盒应用, 测序优化及数据分析。讲座涉及到mRNA, 总RNA,靶向RNA及 小RNA测序的基本知识:

▸ RNA Sequencing Part I: Introduction

▸ RNA Sequencing Part II: Kits

▸ RNA Sequencing Part III: Best Practices and Troubleshooting

▸ RNA Sequencing Part IV: Introduction to Analysis

在Part I,我们会介绍在准备RNA测序实验时,需要注意的关键事项。讲座内容涵盖从RNA样本制备,测序到数据分析的一整套流程。该讲座适用于对Illumina二代测序有所了解以及对RNA测序感兴趣或者有需求的客户。

研讨会详情

主  题:RNA Sequencing Part I: Introduction

日  期:2018年10月24日 星期三

时  间:北京时间上午10点

讲  者:Li Ying,Technical Applications Scientist, Illumina

Li Ying
Topic: Services : Customer
Performing In-Depth Microbiome Analysis with the One Codex Bioinformatics Platform

Microbiome research is quickly becoming one of the most exciting fields in the life sciences, driven by the power of next-generation sequencing (NGS). One Codex is a leading platform for rapid, accurate microbiome and metagenomics analysis and is used by researchers across major academic, commercial, and clinical institutions. In this webinar, we will walk through a gut microbiome experiment including sample collection, sequencing, bioinformatics, and analysis.

On the bioinformatics side, we will show how you can easily analyze NGS datasets with the One Codex database of >80,000 whole microbial genomes. We will review several types of microbiome analyses from taxonomic classification to building predictive machine learning models. Finally, we will demonstrate how it can all be performed in a scalable, repeatable fashion, ensuring that your microbiome research is reproducible whether it involves 10 samples or 10,000.

Nick Greenfield, One Codex
Topic: Microbiology & Infectious Disease : Software : Informatics
Illumina在线技术培训研讨会 — Introduction to Amplicon Sequencing

扩增子测序是一种高靶向性测序方法,用于分析特定基因组区域中的基因变异。本次讲座将会和您一起讨论扩增子测序,包括文库制备方法和测序结果优化。讲座内容适用于所有对二代测序感兴趣以及对扩增子测序有需求的客户。

该研讨会将涵盖以下主题:

1. 什么是扩增子文库

2. 扩增子文库建库方法和试剂盒介绍

3. 扩增子测序结果评估及优化

研讨会详情

主  题:Introduction to Amplicon Sequencing

日  期:2018年9月20日 星期四

时  间:北京时间上午10点

讲  者:Chen Hao

Chen Hao
Topic: Services : Customer
Illumina在线技术培训研讨会 — Introduction to MiniSeq

本次网络研讨会中,Illumina Technical Support团队将给您介绍一款桌面型测序平台MiniSeq,和您一起了解MiniSeq测序系统的基本信息以及测序流程的创建、开始和监测,并简要介绍MiniSeq自带的分析工具Local Run Manager。

目标人群为正在使用MiniSeq测序系统或者对MiniSeq感兴趣的用户,希望通过本次网络研讨会帮助用户对MiniSeq测序仪的基本信息和使用方法有更深入的了解。

本次讲座会涵盖以下内容:

• MiniSeq系统简介

• 如何创建并开始一个MiniSeq的Run

• 监测MiniSeq的Run

• MiniSeq仪器自带的Local Run Manager的使用以及分析选项

 

主  题:Introduction to MiniSeq

日  期:2018年8月23日 星期四

时  间:北京时间上午10点

讲  者:Wang Zhongfeng

Wang Zhongfeng
Topic: Services
Illumina在线技术培训研讨会 — MiSeq Run Analysis and Troubleshooting

Illumina Technical Support团队邀请您参加一场有关MiSeq测序系统的讨论盛宴,MiSeq是一款集簇生成,测序及数据分析于一体的测序仪,因其较长的读长使其从测序家族中脱颖而出,本次网络研讨会聚焦于MiSeq测序仪使用过程中的troubleshooting。

目标人群为MiSeq测序系统的使用者,对基本的Illumina测序流程及SAV软件有一定了解。希望通过本次网络研讨会可以使用户对MiSeq测序仪的 troubleshooting及问题解决方案有更深入的了解。

本次讲座会涵盖以下内容:

• Run Setup及Run Start过程中的troubleshooting

• 仪器运行中使用SAV软件对run进行评估

• 仪器使用的经验分享

 

主  题:MiSeq Run Analysis and Troubleshooting

日  期:2018年7月26日 星期四

时  间:北京时间上午10点

讲  者:Zhou Beibei

Zhou Beibei
Topic: Services
Illumina网络研讨会——Illumina测序技术在临床遗传学检测中的应用

我们常见的那些与遗传病相关的数字:

全球已发现的遗传病病种超过7000种,

全球约3亿人受累于各类遗传疾病的困扰,

新生儿重症监护室中,

约1/3的患儿受累于遗传疾病,

30%的遗传病患儿在5岁前离开了人世…

早年遗传疾病的检测依赖于PCR,FISH等传统技术,效率有限,诊断力也有限。近年来,测序技术的飞速发展也带来了疾病诊疗的新时代,Panel测序、临床外显子组测序(cWES)、全外显子测序(WES)甚至是全基因组测序(WGS)都开始在遗传病检测领域崭露头角。今天,我们很高兴与您分享Illumina测序技术在遗传疾病检测中的最新应用进展,期待为您的临床研究以及诊疗工作提供参考。

研讨会详情 

主 题:Illumina测序技术在临床遗传学检测中的应用

日 期:2018年6月15日  星期五

时 间:北京时间  上午 10:00-11:00

讲 者:谭珂  Illumina大中华区遗传检测市场经理

Topic: Reproductive & Genetic Health
Illumina在线技术研讨会 —— NovaSeq 测序仪介绍

本次讲座将涉及NovaSeq 仪器概述,工作流程,日常维护以及如何简单处理运行中出现的问题。讲座内容适用于所有对Illumina NovaSeq 测序仪感兴趣的的用户。

主  题: NovaSeq 测序仪介绍
日  期: 2018年5月23日 星期三
时  间: 10.00 a.m.(北京时间)
讲  者: Xin Li
Xin Li
Topic: Services
Illumina在线技术研讨会 — Introduction to AmpliSeq for Illumina

当领先的文库制备试剂盒优化后,遇上Illumina二代测序平台,会产生什么样的化学反应?

Illumina技术支持团队将在这个讲座里将向您介绍针对于Illumina测序平台的AmpliSeq文库制备试剂盒。 通过本次讲座,您将知道AmpliSeq文库构建试剂盒的工作原理,工作流程及目前可用于Illumina测序平台的一些AmpliSeq panel,同时我们还会对DesignStudio和AmpliSeq的数据分析进行介绍。讲座内容适用于所有对二代测序感兴趣以及对靶向测序文库制备有需求的客户。

主题: Introduction to AmpliSeq for Illumina

日期: 2018年4月12日 星期四

时间: 10.00 a.m.(北京时间)

讲者: Chen Hao, Cheng Xianying

Chen Hao, Cheng Xianying
Topic: Services
Illumina在线技术研讨会 — Nextera DNA Flex Library Prep Kit介绍

我们将在这个讲座里将向您介绍Nextera DNA Flex文库构建试剂盒。 通过本次讲座,您将知道Nextera DNA Flex文库构建试剂盒的工作原理,工作流程及其独有的特点和广泛的应用。讲座内容适用于所有对二代测序感兴趣以及对快速简单构建广泛DNA文库有需求的客户。

Nextera DNA Flex文库构建试剂盒的亮点:

1.快速的文库制备时间(~3hr)

2.整合多种类型的样本制备 

3.灵活的流程和广泛的DNA起始量(1-500ng)

4.应用范围广(支持从微生物等小基因组,扩增子到大基因组)

5.优化的性能

 

主  题:Nextera DNA Flex Library Prep Kit介绍

日  期:2018年3月22日 星期四

时  间:北京时间上午10点
讲  者:Zhou Beibei

Topic: Services
Illumina在线研讨会 — 认识您的实验室新伙伴 — iSeq 100测序系统

iSeq 100系统使得新一代测序(NGS)技术的运用比以往任何时候都更简单,也更经济。简约的设计让任何规模的实验室只需按下按钮,即可对DNA和RNA进行测序。iSeq 100系统为小规模的独立的NGS项目提供了一套经济高效的解决方案。在本次网络研讨会期间,您将了解到在多种应用场景下研究人员如何方便的使用iSeq,而无需为更高通量的系统耗时等待积攒最佳样本量或寻求外包服务。您将了解到可以在iSeq 100系统上运行的各种应用和方法,以及此系统将如何满足您实验室的研究需求。您还将感受到iSeq 100系统的启动和运行是多么快速和轻松,从而了解如何充分利用您的实验室新伙伴。

 

主题包括:
•  iSeq 100概述:从运行设置到分析
•  应用场景介绍
•  了解该系统适应任何实验室的能力

产品经理 赵琳琳
Topic: Sequencing : Customer
AmpliSeq for Illumina——适用于Illumina测序系统的快速、简单且稳定的靶向文库制备试剂

利用AmpliSeq for Illumina解决方案提升您的靶向重测序能力。本次网络研讨会,我们将介绍AmpliSeq for Illumina解决方案在各种类型的样本上的稳定性能,包括低质量的FFPE组织。利用低至1 ng的起始材料在5小时内制备DNA或RNA文库,并在Illumina平台上测序,然后利用我们一体化的信息学方案分析数据。Illumina提供即用型panel和定制型panel以及世界一流的服务和支持。作为您值得信赖的合作伙伴,Illumina将助力您在各种疾病领域的研究。

Cao Youpei
Topic: Cancer Genomics : Customer
Illumina在线技术研讨会 — Introduction to SBS Chemistry

会议概要:
本次讲座将会和您一起讨论Illumina文库制备、簇生成以及边合成边测序化学相关的基本内容。通过本次讲座,您将了解到Illumina文库构建过程和要点、不同平台的簇生成的方法、边合成边测序的化学过程、Multiplexing以及初级分析过程。讲座内容适用于准备或者刚开始使用Illumina测序平台的用户。

主  题: Introduction to SBS Chemistry
日  期: 2018年1月10日 星期三
时  间: 上午10点(北京时间)
讲  者: Zhongfeng Wang
Zhongfeng Wang
Topic: Services
Illumina在线技术研讨会 — 16S宏基因组测序和数据分析介绍

本次讲座将介绍16S宏基因组测序文库制备方法,Miseq上机测序以及16s的数据分析流程。本次讲座包括以下主题:
-16s 文库制备protocol介绍
-Miseq 16S测序上机参数设置
-16s宏基因组数据分析

主题:

16S宏基因组测序和数据分析介绍

日期:

2017年12月21日 星期四

时间:

上午10点(北京时间)

讲者:

Xin LI & Ying XU
Xin LI & Ying XU
Topic: Services
Illumina在线技术研讨会 — Introduction to bcl2fastq v2+

本次讲座将会和您一起讨论如何利用bcl2fastq软件将测序仪生成的base call文件转换成fastq文件同时完成样本拆分。通过本次讲座,您将了解到:安装bcl2fastq软件的系统要求,如何运用命令行使用bcl2fastq软件,bcl2fastq常用的参数介绍等等。讲座内容适用于所有使用illumina测序平台的用户。

主题:

Introduction to bcl2fastq v2+

日期:

2017年12月13日 星期三

时间:

10.00 a.m.(CNT)

讲者:

Jiajia Xu

Jiajia Xu
Topic: Services
Illumina在线讲座 | 靶向重测序解决方案及数据分析

靶向重测序涉及到从样品文库中分离出感兴趣的基因组区域,高效且经济地发挥NGS技术的优势,以实现生殖系和体细胞变异的经济、系统检测。无论是开展癌症研究、微生物基因组学、农业基因组学,还是分子流行病学,研究人员都能够靶定与他们感兴趣的特定基因组区域。随着NGS测序成本的下降,靶向测序方法正帮助越来越多的研究者,了解复杂疾病的发病机理,确定重要经济作物的抗病基因,推动生物医药的创新发展。

Illumina提供了从样本到数据的完整靶向重测序解决方案,涵盖了内容设计、文库制备、测序和数据分析各个环节。无论是杂交捕获测序还是扩增子测序,都比以往任何时候都更简单、更触手可及。

在Illumina微信公众平台NGS靶向重测序专题讲堂上我们精心准备了6篇专题文章,系统介绍靶向测序相关应用和Illumina靶向测序解决方案。我们还将邀请Illumina市场部和生物信息部门专家,为您带来Illumina 靶向重测序解决方案及数据分析在线讲座。想更好地了解靶向测序的应用范围、技术优势?想学习如何设计靶向测序实验,如何分析解读数据?敬请参加我们的在线讲座。

主题:Illumina靶向重测序解决方案及数据分析简介

日期:2017年12月8日 星期五

时间:2.00 p.m.

讲者:许颖 & 曹友培

许颖 & 曹友培
Topic: Sequencing
Enabling efficient Discovery and Clinical Research in drug response: Application of a targeted Next-Generation Sequencing Assay for Pharmacogenetics

Pharmacogenetic (PGx) testing enables researchers to understand a person’s genetic propensity for a therapeutic response or an adverse reaction to particular medications. Recently the NIH’s Precision Medicine Initiative has begun a nationwide effort to individualize a subject’s treatment program, while the FDA has already included PGx information in over one hundred drug labels. Serious drug reaction events are likely to become more prevalent as more drugs become available and the number of pharmaceuticals each person is taking increases. To understand the occurrence of these events, sequencing genomic regions associated with metabolism of a wide-spectrum of drug classes can help inform clinical researchers, and better characterize the frequency of known and novel haplotypes within validated genes involved in drug metabolism pathways.

In this presentation, we will describe a method and workflow for targeted pharmacogenetic gene sequencing using Kailos’ TargetRichTM PGxComplete assay.

Julie Collens, Associate Director, Market Development, Illumina , Troy Moore, Chief Scientific Officer and Founder, Kailos Genetics
Topic: Sequencing : Diagnostics : Customer
Illumina在线技术研讨会 — Assessing Run Quality with SAV and FastQC

本次讲座将会和您一起讨论如何利用Sequencing Analysis Viewer(SAV)和FastQC软件分析测序数据的质量。通过本次讲座,您将了解到:如何查到不同的测序类型、不同测序平台的参数指标;如何通过SAV软件来判断测序是否达到了指标;如何通过FastQC软件来分析测序结果的潜在问题和可靠性;提高测序质量和产出的一些操作建议。讲座内容适用于所有使用illumina测序平台的用户。

主题:

Assessing Run Quality with SAV and FastQC

日期:

2017年11月08日 星期三

时间:

10.00 a.m.(CNT)

讲者:

Zhongfeng Wang & Jiajia Xu

Zhongfeng Wang & Jiajia Xu
Topic: Services
Illumina在线技术研讨会 — NovaSeq测序仪介绍

本次讲座将涉及NovaSeq 仪器概述,工作流程,日常维护以及如何简单处理运行中出现的问题。讲座内容适用于所有对Illumina NovaSeq测序仪感兴趣的的用户。

主  题: Illumina在线技术研讨会 — NovaSeq 测序仪介绍
日  期: 2017年10月12日 星期四
时  间: 10.00 a.m.(CNT)
讲  者: Rui Fan

 

Rui Fan
Topic: Services
Illumina在线技术培训研讨会 — Enrichment sequencing: 文库制备及数据分析

本次讲座,illumina技术支持将和您一起探讨Enrichment sequencing的建库方法以及后续数据分析。 通过本次讲座,您将了解到靶向重测序的建库原理、流程、数据分析步骤以及数据结果等相关内容。讲座内容适用于所有使用illumina测序平台的用户。

主题:

Enrichment sequencing: 文库制备及数据分析

日期:

2017年09月20日 星期三

时间:

10.00 a.m.(CNT)

讲者:

Beibei Zhou
Jiajia Xu

Beibei Zhou,Jiajia Xu
Topic: Services
Illumina Bio — Rad SureCell单细胞RNA测序

主题:

Illumina Bio — Rad SureCell单细胞RNA测序

日期:

2017年08月31日 星期四

时间:

10.00 a.m.(CNT)

讲者:

Xin Li
Ying Xu

会议概要:
本次研讨会主要面向对Illumina公司与Bio-Rad公司合作单细胞RNA测序解决方案感兴趣的客户。该技术结合了高度创新的Bio-Rad微滴式数字PCR技术(ddseq™)与Illumina公司的新一代测序(NGS)文库制备、测序和分析技术。该研讨会将涵盖以下主题:

  • 单细胞RNA测序介绍
  • Illumina /Bio-Rad surecell WTA单细胞RNA文库制备试剂盒的详细工作流程,测序运行设置,应用Basespace APP分析处理单细胞surecell RNA数据。
Xin Li,Ying Xu
Topic: Services
RNA sequencing:文库制备及数据分析

本次讲座,illumina技术支持将和您一起探讨RNA-seq的建库方法以及后续数据分析。 通过本次讲座,您将了解到RNA-seq的建库原理、流程、数据分析步骤以及数据结果等相关内容。讲座内容适用于所有使用illumina测序平台的用户。

主  题: RNA sequencing:文库制备及数据分析
日  期: 2017年07月13日 星期四
时  间: 10.00 a.m.(CNT)
讲  者: Rui Fan 
Jinli Zhang
Rui Fan;Jinli Zhang
Topic: Sequencing : Services
Low Diversity文库的测序考虑

碱基组成多样性差的文库(low diversity libraries),比如扩增子测序,会对Illumina测序平台产出高质量的数据带来挑战,影响软件的数据处理性能并导致产出的数据质量降低。 本次研讨会主要面对进行low diversity文库测序的客户,将涵盖以下主题:

  • 通过SVA软件来查看及了解文库碱基组成
  • Low diversity文库进行测序优化的策略
  • 不同测序平台对Phix文库掺入比例的建议
  • 碱基识别和Q值计算的概述
主  题: Low Diversity文库的测序考虑
日  期: 2017年06月29日 星期四
时  间: 10.00 a.m.(CNT)
讲  者: Xin Li

 

Xin Li
Topic: Services
The Effective Implementation of NIPT into a Busy Practice: An Obstetrician Perspective

Medical societies now recommend that all women, regardless of age, be offered screening and diagnostic testing for aneuploidy during pregnancy.1-2 Noninvasive prenatal testing (NIPT) is a newer screening option that utilizes the presence of cell-free DNA in a pregnant woman’s blood originating from the pregnancy. Whole-genome sequencing-based NIPT can screen for common aneuploidies (trisomy 21, trisomy 18, trisomy 13, and certain sex chromosome aneuploidies) with greater accuracy than other available screening modalities, resulting in a significant reduction in false positive rates and, subsequently, potential reduction in invasive procedures in healthy pregnancies.3


In this webinar, Tina Ziainia, MD, FACOG, an Obstetrician-Gynecologist affiliated with Sharp HealthCare, provides insight and expertise on successfully implementing NIPT into a busy practice. Having been in practice for over 17 years and having offered NIPT since 2013, she’ll also discuss prenatal screening options, review the latest ACOG and ACMG screening guidelines, and identify helpful resources for both you and your patients.

 

References: 

1. Practice Bulletin No. 163: Screening for Fetal Aneuploidy. Obstet Gynecol. 2016;127(5):979-981.

2. Gregg AR, Skotko BG, Benkendorf JL, et al. Noninvasive prenatal screening for fetal aneuploidy, 2016 update: a position statement of the American College of Medical Genetics and Genomics. Genet Med. 2016: doi:10.1038/gim.2016.97.
3. Bianchi DW, Rava RP, Sehnert AJ. DNA sequencing versus standard prenatal aneuploidy screening. N Engl J Med. 2014;371(6):578.

Tina Ziainia, MD, FACOG, Sharp HealthCare
Topic: Reproductive & Genetic Health
Illumina在线技术研讨会 — Optimizing Cluster Density (优化簇密度)

本次讲座,illumina技术支持将和您一起探讨如何在测序实验中优化cluster的密度。通过本次讲座,您将了解到插入片段长度、变性条件、上样浓度、文库长度以及文库类型等因素是如何影响cluster密度的,有助于您在今后的实验中获得比较好的的cluster密度。讲座内容适用于所有使用illumina测序平台的用户。

主题:

Optimizing Cluster Density (优化簇密度)

日期:

2017年05月10日 星期三

时间:

10.00 a.m.(CNT)

讲者:

Zhongfeng Wang

Topic: Services
Illumina在线技术研讨会 — NextSeq 500常见问题案例分享及仪器健康信息传送功能介绍

本次讲座将和我们的新老朋友们分享NextSeq 500使用过程中可能会出现的一些问题。面对这些问题,我们如何做简单的问题排查。为了避免一些问题的出现,我们需要做哪些机器的日常维护。最后会给大家介绍仪器健康信息传送功能。讲座内容适用于使用Illumina NextSeq 500 的客户及所有对Illumina二代测序仪感兴趣的朋友。

主  题: NextSeq 500 常见问题案例分享及仪器健康信息传送功能介绍
日  期: 2017年04月26日 星期三
时  间: 10.00 a.m.(CNT)
讲  者: Rui Fan
Rui Fan
Topic: Services : Customer
Illumina在线技术研讨会 — Library QC and Troubleshooting with the Bioanalyzer

Illumina技术支持团队正在开展一系列在线技术培训研讨会,该研讨会将涵盖样本制备、测序流程和后续分析等。讲座内容大部分是围绕全球范围内客户经常提及并关注的相关问题,并且每个技术讲座的尾声都安排了Q&A环节。首次注册参会只需点击“Register Now”按钮。如您无法参加当天会议,请发邮件至techsupport@illumina.com,我们将会给您发送会议视频链接。
 
主题:    Library QC and Troubleshooting with the Bioanalyzer
日期:    2017年03月22日 星期三
时间:    10.00 a.m.(CNT)
讲者:    Zhou Beibei

概要:
本次讲座里将和您一起探讨如何使用Agilent Bioanalyzer 进行测序前文库的质量控制及文库质控结果的troubleshooting,通过本次讲座,您将知道理想文库的条带分布,能够识别异常文库条带分布并分析其原因,同时了解如何防止异常文库的出现。讲座内容适用于所有使用illumina样本制备试剂盒的用户及对二代测序感兴趣的用户。

请把这封邮件邀请发给您的同事,或其他感兴趣的人,邀请他们一起参加。

Zhou Beibei
Topic: Agriculture Genomics : Cancer Genomics : Forensic Genomics : Reproductive & Genetic Health : Microbiology & Infectious Disease : Sequencing
在线讲座 | 了解NovaSeq™系列如何工作(第二场)

无论何种基因组、何种测序方法和规模都有可扩展的通量,灵活简便。
使用NovaSeq系列发掘测序的新纪元。参加在线研讨会,一起直观了解我们如何重新定义了高通量测序技术可以实现的事情。NovaSeq系列为了实现您的科学愿景重新打造,灵活简便、扩展自如,通过一系列广泛的应用,助您比以往任何时候都更快、更经济地完成项目。

任岩,产品经理,Illumina中国
Topic: Agriculture Genomics : Cancer Genomics : Reproductive & Genetic Health : Human Genetics & Genetic Disease : Microbiology & Infectious Disease : Sequencing : Diagnostics : Software : Informatics : Services : HLA Typing : Customer
Illumina TruSight HLA Case Study Webinar Series HLA typing of buccal swabs using TruSight HLA

The Webinar Series will feature HLA laboratory directors presenting case studies from samples prepared with TruSight HLA , sequenced with Illumina next-generation sequencing (NGS) MiSeq or MiniSeq systems, and analyzed using TruSight HLA Assign software.

Eric T. Weimer, PhD, D (ABMLI), University of North Carolina at Chapel Hill School of Medicine
Topic: HLA Typing
在线讲座 | 了解NovaSeq™系列如何工作(第一场)

无论何种基因组、何种测序方法和规模都有可扩展的通量,灵活简便。
使用NovaSeq系列发掘测序的新纪元。参加在线研讨会,一起直观了解我们如何重新定义了高通量测序技术可以实现的事情。NovaSeq系列为了实现您的科学愿景重新打造,灵活简便、扩展自如,通过一系列广泛的应用,助您比以往任何时候都更快、更经济地完成项目。

任岩,产品经理,Illumina中国
Topic: Agriculture Genomics : Cancer Genomics : Forensic Genomics : Reproductive & Genetic Health : Human Genetics & Genetic Disease : Microbiology & Infectious Disease : Sequencing : Diagnostics : Software : Informatics : Services : HLA Typing
See the NovaSeq Series in action(语言:英语;时区:美国太平洋时间)

Discover a new era of sequencing with the NovaSeq Series. Join us for a live webinar event to see firsthand how we are redefining what is possible with high-throughput sequencing. Built from the ground up to fulfill your scientific visions, the NovaSeq Series gives you the flexibility and scalability to complete projects faster and more economically than ever before across a broad range of applications.

Webinar at a glance

  • Overview of instrument and consumables
  • Demonstration from run setup through data analysis
  • Data analysis using BaseSpace® Sequence Hub
Brian Steffy, David Miller, and Aboli Rane, Illumina
Topic: Sequencing
Illumina针对FFPE样本分子检测方案(DNA水平)

疾病研究和病理分析中,由于通过手术、穿刺等方式获取的组织样本离开机体后,很快就会发生死亡及组织腐败,丧失原有正常的结构和功能。因此,离体的组织要经固定、石蜡包埋、切片及染色等步骤以避免细胞组织死亡,进而进行形态结构分析及免疫或分子分析等。福尔马林固定石蜡包埋( Formalin Fixed and Paraffin Embedde,FFPE)成为病理学,法医病理学等进行样本保存的最主要手段。对组织样本进行FFPE的保存,有助于研究人员更加全面地了解经多年保存后的病理标本中所包含的遗传机制和病理成因。目前,全球约有2-4亿FFPE组织样本,这些组织样本已经是疾病诊断和科学研究的最为宝贵的的生物学资源之一。

随着基因组学检测技术的快速发展,尤其新一代测序技术(NGS)的飞速发展,在细胞分子水平提供了前所未有的检测能力,研究人员可以使用这一技术手段,重新开启FFPE样本宝藏的大门,寻找疾病与基因关系,进而去解释疾病的未解之谜。然而,在FFPE组织标本的制备和贮存过程中,组织经福尔马林固定、石蜡包埋后很容易引起DNA的交联和降解,研究人员很难获得足量的高质量的DNA样本,这也对新的检测技术提出新的要求。

Illumina提供一整套针对FFPE样本的NGS检测方案,针对FFPE样本的处理进行优化,分别从DNA水平,RNA水平及甲基化水平提供更全面的检测。

Yajun Wang, PhD, Team Leader, Translational and Applied Segments Marketing, Illumina
Topic: Cancer Genomics
Illumina在线技术培训研讨会—Introduction to Illumina Sequencing System

Illumina技术支持团队正在开展一系列在线技术培训研讨会,该研讨会将涵盖样本制备、测序流程和后续分析等。讲座内容大部分是围绕全球范围内客户经常提及并关注的相关问题。我们还将在每个技术讲座的尾声安排Q&A环节。

主题: Introduction to Illumina Sequencing System
日期: 2017年01月11日,星期三
时间: 10.00 a.m.(CNT)

讲者: Zhou Beibei

会议概要 
我们的技术支持专家会在这个讲座里和您介绍Illumina测序系统,内容包括不同测序仪性能、特点、测序指标、测序系统操作流程及仪器的维护。讲座内容适用于所有对Illumina技术和产品感兴趣的客户,尤其是拥有或准备购买Illumina测序仪的新用户。

Zhou Beibei
Topic: Services
Illumina针对FFPE样本分子检测方案(DNA水平)

疾病研究和病理分析中,由于通过手术、穿刺等方式获取的组织样本离开机体后,很快就会发生死亡及组织腐败,丧失原有正常的结构和功能。因此,离体的组织要经固定、石蜡包埋、切片及染色等步骤以避免细胞组织死亡,进而进行形态结构分析及免疫或分子分析等。福尔马林固定石蜡包埋( Formalin Fixed and Paraffin Embedde,FFPE)成为病理学,法医病理学等进行样本保存的最主要手段。对组织样本进行FFPE的保存,有助于研究人员更加全面地了解经多年保存后的病理标本中所包含的遗传机制和病理成因。目前,全球约有2-4亿FFPE组织样本,这些组织样本已经是疾病诊断和科学研究的最为宝贵的的生物学资源之一。

随着基因组学检测技术的快速发展,尤其新一代测序技术(NGS)的飞速发展,在细胞分子水平提供了前所未有的检测能力,研究人员可以使用这一技术手段,重新开启FFPE样本宝藏的大门,寻找疾病与基因关系,进而去解释疾病的未解之谜。然而,在FFPE组织标本的制备和贮存过程中,组织经福尔马林固定、石蜡包埋后很容易引起DNA的交联和降解,研究人员很难获得足量的高质量的DNA样本,这也对新的检测技术提出新的要求。

Illumina提供一整套针对FFPE样本的NGS检测方案,针对FFPE样本的处理进行优化,分别从DNA水平,RNA水平及甲基化水平提供更全面的检测。

Yajun Wang, PhD, Team Leader, Translational and Applied Segments Marketing, Illumina
Topic: Cancer Genomics
Illumina针对FFPE样本分子检测方案 (RNA及甲基化水平)

Illumina提供一整套针对FFPE样本的NGS检测方案,针对FFPE样本的处理进行优化,分别从DNA水平,RNA水平及甲基化水平提供更全面的检测。同时,我们将安排相应的在线讲座,从样本准备,QC应用方案为您带来更全面深入的介绍。

 

Ran Lin (Aaron), PhD, Product Marketing Manager, Illumina
Topic: Cancer Genomics
Introduction to BaseSpace® Variant Interpreter (Beta) and an overview of the workflow

Simplifying and Expediting Genomic Workflows with Integrated Informatics.

Until now, managing, analyzing, and interpreting genomic data has been an arduous process that required disparate data systems and the need to assemble a diverse set of software applications.

In this succinct webinar, we address how BaseSpace Variant Interpreter (Beta), the newest member of the BaseSpace Informatics Suite, can help clinical research labs quickly identify, annotate, and classify disease-relevant variants and summarize significant findings in one report. Integrated with BaseSpace Sequence Hub, BaseSpace Variant Interpreter enables rapid extraction to biological insight while increasing a genomic clinical research lab’s operational efficiency with a scalable secure solution.

This webinar is part of a series exploring BaseSpace Informatics Suite. Details of additional events will be presented during the webinar.

Rebecca Hemenway, M.S. Sr. Product Manager. Donavan Cheng, Ph.D. Director, Bioinformatics., Illumina
Topic: Informatics
PPV of NIPT: Maximizing the value of NIPT for your patients

Join Dr Tracy Prosen to better understand the performance characteristics of noninvasive prenatal testing (NIPT), with a special focus on positive predictive value (PPV). 

After attending, you’ll be able to:

•    Describe how PPV varies for different conditions and in different testing populations
•    Calculate PPVs for effective counseling of patients with positive NIPT results

Tracy Prosen, MD, Assistant Professor, Department of Obstetrics, Gynecology and Women’s Health, University of Minnesota
Topic: Reproductive & Genetic Health
MiniSeq测序仪介绍

在本次讲座会我们主要介绍Illumina最新的MiniSeq测序仪,我们将了解到该系统如何工作,并了解数据在本地分析需要的软件及工作流程,以及如何对运行中出现的问题进行简单的处理。

Xin Li, Technical Application Scientist
Topic: Sequencing
Unravelling Hematological Disorders Using Targeted NGS Panels

Prof. Torsten Haferlach, Head of MLL Munich Leukemia Laboratory, will discuss how their laboratory has implemented NGS technology for sequencing targeted gene panels.

 

Join in to hear about

·       Application of NGS to molecular pathology assessment of hematological malignancies

·       Integrated process for data analysis and reporting results

 

Join the live webinar event and participate in the Q&A session!

Prof. Dr. Dr. Torsten Haferlach, Head of Cytomorphology, MLL Munich Leukemia Laboratory
Topic: Cancer Genomics
The Clinical Implications of NIPT Failures

If you offer noninvasive prenatal testing (NIPT), it’s essential to understand the frequency and implications of test failures.

NIPT failures are often overlooked as a test metric.  Failure rates vary significantly based on the platform used for testing.  Recent publications suggest an increased risk of aneuploidy in pregnancies with a noninvasive prenatal test failure.

Join Professor Yuval Yaron, Director of the Prenatal Diagnosis Unit at the Tel Aviv Sourasky Medical Center, as he provides insights regarding NIPT failures. Professor Yaron will discuss publications on NIPT failures and their impact on performance statistics such as sensitivity and positive predictive value (PPV) as well as patient management.

 

 

 

Yuval Yaron, MD, Director, Prenatal Diagnosis Unit, Genetic Institute at the Tel Aviv Sourasky Medical Center
Topic: Reproductive & Genetic Health
Illumina在线讲座 | MiniSeq系统介绍,迄今最为简单经济的新一代测序,已在身边

新一代测序技术(NGS)经过几年的发展,已经从最初的只有少数实验室使用得起发展到成为科研的日常工具了。而得益于技术的成熟和成本的降低,如今这项技 术更是已经走入了更广阔的应用领域,比如农业,生殖遗传健康,肿瘤,微生物等等,成为了精准医疗的关键工具。Illumina作为NGS领域的领导者,一 直以来都在推动这项技术的发展,从GA到HiSeq,MiSeq及NextSeq,从昂贵成本到千美元人类基因组。如今,Illumina更是推出了迄今 最为简单经济的NGS解决方案,使得更多的实验室能够拥有自己的NGS技术。

这次报告,我们将介绍Illumina在2016年初推出的最新NGS平台——MiniSeq,了解它的简单迅捷的工作流程,优秀性能表现及在肿瘤和基础研究中的靶向测序应用。

肖瑾
Topic: Sequencing