Illumina SomaSeq Discovery

정확하고 재현 가능한 단백질 정량화 및 생물학적 인사이트를 도출하기 위해 SOMAmer 기술을 사용하는 자동화된 초다중 단백체학 솔루션.

개요

Illumina SomaSeq Discovery는 높은 친화성과 특이도로 단백질과 결합하는 합성 단일클론 SOMAmer 시약을 사용하여 assay 폭과 검출 민감도 간의 상충 관계를 해소하는 고함량 단백체학 assay입니다.

주요 기능

  • 단일 샘플에서 11K 단백질 측정 분석

  • 4시간의 수작업 시간으로 2.5일 이내에 샘플 채취 

  • 엄격한 다단계 적격성 평가 프로세스를 통해 확인된 특이도 및 민감도를 포함한 시약 성능

  • 혈액, 세포 용해물 및 조직 균질물을 포함한 다양한 샘플 종류에서 단백질 검출

가장 광범위한 단백체 커버리지

단일 assay에서 200개 이상의 생물학적 경로에 걸쳐 11K 단백질 측정을 적용하여 다른 NGS 기반 단백체학 assay보다 모든 주요 생물학적 프로세스에서 더 많은 단백질을 검출하여 새로운 바이오마커 및 경로 수준 변화를 밝혀냅니다.

높은 민감도

농도가 10자릿수 이상에 걸쳐 분포하는 단백질에 대해 펨토몰 수준의 민감도를 달성하여 희귀 단백질부터 풍부한 단백질까지 아우르는 풍부한 데이터세트를 얻을 수 있습니다.

대규모 분석에서도 뛰어난 정밀도

파일럿 연구부터 인구집단 규모의 연구까지 재현성을 유지합니다. SomaSeq Discovery는 주당 최대 340개의 샘플과 44개의 대조군을 처리하는 초다중 자동화 워크플로우를 제공합니다. SOMAmer 시약은 정확성을 위해 형태 상보성 및 다중 이온 경쟁을 사용하여 비표적 결합을 차단하도록 설계되어, 약 5.5%의 CV*를 달성합니다.

*건강한 기증자의 혈장 및 혈청 샘플을 통합하여 산출한 변동 계수(CV).

중요한 샘플에서의 깊이 있는 분석

SomaSeq Discovery Multi Matrix Kit는 동일한 런 내에서 세포 용해물 및 조직 균질물 분석을 통해 유연한 연구 설계를 지원합니다. 내장된 Advanced Normalization 소프트웨어를 통해 독점 세포주 또는 연구별 참조 샘플에 대한 정규화가 가능합니다.

사양

필수 제품

옵션 1: 자체 랩에서 실행

Illumina SomaSeq Discovery assay를 자체적으로 실행하려면 다음이 필요합니다.

필요한 기기

• Illumina SomaSeq Discovery Automation System(카탈로그 번호 20116818), Tecan Fluent 780, 데크에서 assay를 완전히 자동화하는 데 필요한 부품 포함

• 호환 가능한 시퀀싱 시스템: NovaSeq X 시스템, NovaSeq X Plus 시스템 또는 NovaSeq 6000 시스템

assay 키트(샘플 종류에 따라 선택)

• Illumina SomaSeq Discovery Plasma, 96 reactions(카탈로그 번호 20137827)

• Illumina SomaSeq Discovery Serum, 96 reactions(카탈로그 번호 20137828)

• Illumina SomaSeq Discovery, Multi Matrix Kit

인덱싱

• Illumina DNA/RNA UD Indexes (96 indexes, 96 samples)

• Set A(카탈로그 번호 20141196)

• Set B(카탈로그 번호 20141197)

• Set C(카탈로그 번호 20141198)

• Set D(카탈로그 번호 20141199)

옵션 2: 자체적으로 assay를 실행하길 원치 않는 경우 서비스 제공업체와 협력. Illumina 인증 서비스 제공업체가 워크플로우를 대신 수행할 수 있습니다.

• 처리 및 분석을 위해 귀하의 샘플을 서비스 제공업체로 보냅니다(샘플 배송)

• Matrix™ 튜브(0.5 mL 스크류 탑, 카탈로그 번호: 3744)

• 현장별 요구 사항은 서비스 제공업체에 문의하세요. 

서비스 제공업체 페이지를 방문하여 파트너를 찾고 시작해 보세요.

/ 건

애플리케이션

Illumina SomaSeq Discovery는 약 11,000개의 단백질 측정을 위한 바로 시퀀싱 가능한 라이브러리를 제공하여 바이오마커 연구, 중개 과학 및 집단 유전학 연구 전반에서 단백질체 프로파일링 및 정량화 애플리케이션을 지원합니다.

워크플로우 예시

1
프렙

Illumina SomaSeq Discovery

Illumina SomaSeq Discovery는 포괄적인 NGS 기반 assay를 위해 Sequencing by synthesis(SBS) chemistry와 SOMAmer 시약을 결합합니다. 새로운 사전 플레이팅 키트는 assay 설정을 간소화하는 동시에 Illumina SomaSeq Automation System에서 전체 워크플로우가 자동화됩니다.

2
시퀀스
3
분석

DRAGEN 단백질 정량화

완전한 표준화 및 단백질 발현 정량화를 위한 시퀀싱 후 통합 2차 분석 파이프라인이 자동으로 개시됩니다.

Illumina Connected Multiomics

대화형 시각화 및 통계 분석 기능을 갖춘 강력한 오믹스 분석 소프트웨어를 통해 유의미한 단백질 변화와 생물학적 인사이트를 밝혀냅니다.

 

프로젝트 권장 사항

기기 권장 샘플 수 리드 길이
NovaSeq 6000 시스템

혈장, 혈청 키트:

S4 35c 플로우 셀에서 런당 170개의 샘플 및 22개의 대조군

Multi Matrix Kit:

S4 35c 플로우 셀에서 런당 180개의 샘플 및 12개의 대조군

40M 리드, 1 x 15

NovaSeq X 시스템

혈장 또는 혈청 키트:

5B 100c 플로우 셀에서 런당 85개의 샘플 및 11개의 대조군

10B 100c 플로우 셀에서 런당 170개의 샘플 및 22개의 대조군

25B 100c 플로우 셀에서 런당 340개의 샘플 및 44개의 대조군

Multi Matrix Kit:

10B 100c 플로우 셀에서 런당 180개의 샘플 및 12개의 대조군 

25B 100c 플로우 셀에서 런당 360개의 샘플 및 24개의 대조군

5B 100c 플로우 셀에서 런당 90개의 샘플 및 6개의 대조군

40M 리드, 1 x 15

관련 애플리케이션 및 방법

문서

제품 관련 자료

그림 자료

Overview of the Illumina SomaSeq solution

SomaSeq 솔루션 개요

생물학적 샘플의 단백질은 SOMAmer 시약으로 포획된 후, Illumina SomaSeq Automation System에서 자동화된 Illumina SomaSeq Discovery를 거쳐 NovaSeq 시스템에서 시퀀싱됩니다.

Protein-capture using the SOMAScan assay

SOMAmer 단백체학을 사용한 단백질 포획

이 이중 포획 접근법은 높은 특이도와 낮은 배경 잡음을 가능하게 합니다. SOMAmer는 3D 형태를 기반으로 단백질을 표적화하고 경쟁 물질을 사용하는 단계를 통해 비특이적 결합을 제거하여 정확한 측정을 보장합니다.

lllumina Protein Prep NGS conversion chemistry

Illumina SomaSeq Discovery NGS 전환 chemistry

SOMAmer 시약을 사용한 이중 포획 접근법에 따라, 하이브리드화 기반 방법을 사용하여 시약 풍부도를 바코드화되고 바로 시퀀싱 가능한 라이브러리로 변환하여 단백질 정량화를 가능하게 합니다.

리소스

축소판

Illumina SomaSeq Discovery: 단백체학의 새로운 표준

NGS 기반 SomaSeq Discovery 솔루션으로 단백체학의 다음 시대를 열어보세요. NovaSeq 6000 및 NovaSeq X 시스템으로 고처리량 발견 역량, 시장 최고의 성능 및 통합 분석을 활용하여 차세대 단백체학 혁신을 가속화하세요.

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Illumina SomaSeq Discovery를 이용한 정밀 단백체학

SomaSeq Discovery는 탁월한 특이도로 높은 처리량의 단백체학 인사이트를 제공하여 단일 샘플에서 9,500개 이상의 고유한 인간 단백질을 정확하게 검출할 수 있습니다. 엄격한 검증을 거친 SOMAmer 시약에 기반한 이 솔루션은 연구원들이 자신 있게 단백질을 식별하고 정량화하여 바이오마커와 신약 개발을 가속화할 수 있도록 지원합니다.

축소판

단백체학의 진화하는 환경

HUPO World Congress 2025에서 University of Sydney 질량분석 디렉터인 Stuart Cordwell 박사와 함께 단백체학의 향후 방향과 재현성, 넓은 동적 범위, SOMAmer 기반 도구가 정밀 의학 연구를 위한 보다 효과적인 바이오마커 발견을 지원하는 이유를 알아보세요.

축소판

단백체학 워크플로우: 친화성 및 질량분석

HUPO World Congress 2025에서 University of Sydney의 Stuart Cordwell 박사가 질량분석과 친화성 단백체학이 어떻게 서로 보완하여 임상 단백체학 연구를 발전시키는지 살펴봅니다. Stuart Cordwell 박사는 임상 연구 인사이트를 공유하고 확장 가능하고 재현 가능한 바이오마커 발견을 지원하도록 설계된 NGS 기반 접근법인 Illumina SomaSeq Discovery를 소개합니다.

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확장 가능한 NGS 기반 단백체학

HUPO World Congress 2025에서 Illumina Assay 연구개발 부문 부사장 겸 책임자인 Fiona Kaper 박사가 멀티오믹스의 핵심 기둥으로서 확장 가능하고 신뢰할 수 있는 단백체학에 대한 비전을 공유합니다. Fiona Kaper 박사는 질량분석을 상호보완하는 워크플로우에서 높은 신뢰도의 대규모 바이오마커 발견을 가능하게 하도록 설계된 NGS 기반 플랫폼인 Illumina SomaSeq Discovery를 소개합니다.

Beyond the genome

KTH의 SciLifeLab 내 Human Protein Atlas 그룹의 박사 후 연구자인 María Bueno Álvez가 혈장 단백체학이 어떻게 질병 생물학을 밝혀내는지, 수명 전반에 걸쳐 단백체가 얼마나 역동적인지, 그리고 고처리량 단백체학이 스크리닝 도구부터 약물 효과 이해에 이르기까지 정밀 의학을 향한 접근 가능한 경로를 제공하는지에 대해 논의합니다.

라이브러리 프렙 (6)

Illumina SomaSeq Discovery v2, Plasma, 96-reactions

20167042

ILMN SomaSeq Discovery v2, Plasma, 96 Rxns

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Illumina SomaSeq Discovery v2, Serum, 96-reactions

20167043

ILMN SomaSeq Discovery v2, Serum, 96 Rxns

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Illumina SomaSeq Discovery v2, Multi Matrix, 96-reactions

20167045

ILMN SomaSeq Discovery v2, Multi Matrix, 96 Rxns

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Illumina SomaSeq Discovery Plasma (96-Reactions)

20137827

Illumina SomaSeq Discovery Plasma reagents for 96-Reactions.

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Illumina SomaSeq Discovery Serum (96-Reactions)

20137828

Illumina SomaSeq Discovery Serum reagents for 96-Reactions.

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Illumina SomaSeq Automation System

20116818

이 패키지는 Illumina SomaSeq Discovery assay를 자동화하려는 고객을 지원합니다. 여기에는 SomaSeq Discovery assay 프로토콜, 로봇 액세서리 및 assay를 실행하는 Control Software 실행할 수 있는 Tecan Fluent OEM 자동화 시스템이 포함됩니다.

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선택 품목 요약

제품

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단가

자주 묻는 질문

SOMAmer 시약은 3차원 단백질 구조에 결합하는 화학적으로 변형된 소형 압타머(8~20 kDa)입니다. 완전 합성이므로 배치 간 일관된 성능을 제공합니다. 또한 고유한 chemistry 덕분에 현재 항체에 의해 표적화되지 않은 비면역원성 표적 및 에피토프에 결합할 수 있습니다. SOMAmer 기술에 대해 자세히 알아보세요.

단백질 포획에는 SOMAmer 기술(압타머 기반)이 사용됩니다. 이 페이지의 그림 탭에서 SOMAmer 단백체학을 사용한 단백질 포획을 참조하세요.

호환되는 샘플 종류에는 인간 혈장, 혈청, 세포 용해물 및 조직 균질물이 포함됩니다. 추가 샘플 종류가 분석되었지만 현재 워크플로우에서 사용하기 위한 검증은 아직 이루어지지 않았습니다. 대체 샘플 종류에 대한 질문은 Illumina 전문가에게 문의하세요.

Illumina SomaSeq Discovery는 11K 단백질 측정을 제공합니다. 이 패널은 종양학, 신경학, 염증 및 심장학 연구에 관여하는 경로를 포함한 200개 이상의 생물학적 경로의 단백질을 검출하는 데 사용할 수 있습니다.

2차 분석은 단백질 정량화 파일(ADAT)과 DRAGEN QC 보고서를 생성합니다.

2차 분석에 대한 자세한 내용은 데이터 표준화 기술서를 참조하세요.

네, Illumina SomaSeq Automation System을 사용하여 assay를 자동화해야 합니다.

/ 건

NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 chemistry, 광학, 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 시퀀싱 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

NovaSeq X 시리즈 시약 키트

NovaSeq X 시리즈용 시약 키트에는 시약 카트리지, 버퍼 카트리지, 플로우 셀, Lyo insert, 사전 로드 버퍼 및 라이브러리 튜브 스트립이 포함되어 있습니다.

NovaSeq 6000 시스템 주문

NovaSeq™ 6000 시스템으로 강력한 고처리량 시퀀싱 연구를 수행합니다. 데이터 출력과 결과 도출 시간을 프로젝트 요구 사항에 맞추세요.

NovaSeq 6000 Reagent Kit

즉시 사용 가능한 사전 충전 시약 카트리지와 플로우 셀로 구성된 NovaSeq 6000 시스템용 시약 키트.

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