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Illumina TruPath 유전체

기존의 라이브러리 준비 없이 약 10분의 수작업 시간만으로 매우 정확하고 포괄적인 인간 생식세포 전장 유전체 시퀀싱을 제공합니다.

 약 29시간 (시퀀싱 시간을 포함)

Assay 시간

약 10분

수작업 시간

350 ng

사용량

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

TruPath 유전체에는 NovaSeqX  System 소프트웨어 버전 v1.4 이상이 필요합니다.

개요

TruPath 유전체 는 포괄적인 인간 전장 유전체 변이 검출을 위한 가장 간단한 워크플로우를 제공하며,  최소한의 수작업 시간 과 원활한 통합 을 통해  NovaSeq X 시리즈와 연계됩니다.

  • 약 10분의 수작업 준비 시간으로 준비할 수 있는 가장 단순한 샘플-시퀀싱 시스템 워크플로우

  • NovaSeq X 시리즈를 사용하는 단일 assay에서 장거리 유전체 통찰력을 제공하는 고정밀 쇼트 리드 시퀀싱

  • 향상된 구조적 변이 검출, 매핑하기 어려운 영역 해결 및 초장기 페이징을 위한 포괄적이고  정확한 변이 검출

TruPath Genome 솔루션에 대해 자세히 알아보기

사양

Assay 시간  약 29시간 (시퀀싱 시간을 포함)
설명 매핑하기 어려운 영역을 해결하고 구조적 변이 검출 및 단계별 리드와 변이 호출을 개선하여 포괄적인 유전체를 제공합니다.
수작업 시간 약 10분
사용량 350 ng
기기 NovaSeq X 시스템, NovaSeq X Plus 시스템
작용 기전 온플로우 셀 태그멘테이션
방법 전장 유전체 시퀀싱
핵산 종류 DNA
반응 수 키트당 샘플 2개 또는 8개
샘플의 종류 상세 정보 고분자량 DNA 추출 키트 권장
특수 샘플의 종류 혈액, 비강 도말, 타액
종 카테고리 인간
기술 시퀀싱
변이 클래스 짦은 연쇄 반복(STR), 단일 염기 다형성(SNP), 이형접합성 소실(LOH), 염색체 이상, 생식세포 변이, 구조적 변이, 단일 염기서열 변이(SNV), 삽입 결실(Indel), 유전자 복제수 변이(CNV), 유전자 재배열

필수 제품

TruPath 유전체 키트에는 NovaSeq X C2 또는 C8 플로우 셀, TruPath 시약, 소프트웨어 버전 v1.4 이상이 설치된 NovaSeq X 또는 NovaSeq X Plus 시퀀싱 시스템용 필수 시퀀싱 제품 및 DRAGEN Germline 분석이 포함되어 있습니다.

/ 건

애플리케이션

TruPath 유전체는 향상된 커버리지, 더 높은 정확도의 변이 검출 및 전례 없는 간소함을 통해 인간 전장 유전체 시퀀싱을 가능하게 합니다.

워크플로우 예시

1
프렙

TruPath 유전체

2
시퀀스
3
분석

프로젝트 권장 사항

기기 권장 샘플 수 리드 길이
NovaSeq X 시스템

런당 C2 플로우 셀로 샘플 2개, 런당 C8 플로우 셀로 샘플 8개

2 × 150bp
NovaSeq X Plus 시스템

단일 C2 플로우 셀 런으로 샘플 2개, 이중 C2 플로우 셀 런으로 샘플 4개, 단일 C8 플로우 셀 런으로 샘플 8개, 이중 C8 플로우 셀 런으로 샘플 16개

2 × 150bp

관련 애플리케이션 및 방법

매핑된 리드 기술

매핑된 리드 기술로 장거리 유전체 정보를 확보하고, 매핑하기 어려운 영역을 해결하고, 시퀀싱 워크플로우를 간소화해 보세요.

전장 인간 유전체 일배체형

페이징 시퀀싱(phased sequencing)은 모계와 부계의 유전 대립유전자를 구별합니다. 이 정보는 유전 질환 연구에 유용합니다.

문서

제품 관련 자료
지원 문서

비교하기

Illumina TruPath 유전체 TruSeq DNA PCR-Free Illumina DNA PCR-Free Prep
Assay 시간  약 29시간 (시퀀싱 시간을 포함) 총 분석 시간 5시간 ~1.5시간
설명 매핑하기 어려운 영역을 해결하고 구조적 변이 검출 및 단계별 리드와 변이 호출을 개선하여 포괄적인 유전체를 제공합니다. 유전체의 어려운 영역을 통과해 시퀀싱하는 기능을 갖춘 전장 유전체 시퀀싱 연구를 위한 단순한 전체 포함 PCR-free prep입니다. PCR 유도 바이어스를 동시에 제거하고 총 라이브러리 준비 시간을 90분으로 단축하는 온 비드 태그 부착과 PCR이 없는 화학 물질의 고유한 조합을 사용하여 민감한 응용 분야를 위한 시퀀싱 라이브러리를 준비합니다.
수작업 시간 약 10분 4시간 약 45분
사용량 350 ng DNA 1 ug 25~300 ng
기기 NovaSeq X 시스템, NovaSeq X Plus 시스템 MiSeq 시스템, NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, NextSeq 1000 시스템, MiSeqDx(Research Mode), MiniSeq 시스템, NovaSeq X 시스템, NextSeq 500 시스템, NovaSeq 6000 시스템, NovaSeq X Plus 시스템 MiSeq 시스템, NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, NextSeq 1000 시스템, MiSeqDx(Research Mode), NextSeq 550Dx(Research Mode), NovaSeq X 시스템, NextSeq 500 시스템, NovaSeq 6000 시스템, NovaSeq X Plus 시스템
작용 기전 온플로우 셀 태그멘테이션 기계적 DNA 절편화 및 어댑터 라이게이션. 워크플로우는 PCR을 사용하지 않고 겔이 없음. Bead-linked transposome
방법 전장 유전체 시퀀싱 시퀀싱을 통한 지노타이핑, 전장 유전체 시퀀싱, 샷건 시퀀싱 전장 유전체 시퀀싱, De novo 시퀀싱
핵산 종류 DNA DNA DNA
반응 수 키트당 샘플 2개 또는 8개
샘플의 종류 상세 정보 고분자량 DNA 추출 키트 권장
특수 샘플의 종류 혈액, 비강 도말, 타액 FFPE 호환 불가 혈액, FFPE 호환 불가, 사용량이 적은 샘플, 타액
종 카테고리 인간 기타, 포유류, 마우스, 인간, 래트, 식물 모든 종, 인간
기술 시퀀싱 시퀀싱 시퀀싱
변이 클래스 짦은 연쇄 반복(STR), 단일 염기 다형성(SNP), 이형접합성 소실(LOH), 염색체 이상, 생식세포 변이, 구조적 변이, 단일 염기서열 변이(SNV), 삽입 결실(Indel), 유전자 복제수 변이(CNV), 유전자 재배열 단일 염기 다형성(SNP), 유전자 융합, 이형접합성 소실(LOH), 체세포 변이, 염색체 이상, 생식세포 변이, 구조적 변이, 삽입 결실(Indel), 유전자 복제수 변이(CNV) 짦은 연쇄 반복(STR), 단일 염기 다형성(SNP), 체세포 변이, 염색체 이상, 생식세포 변이, 구조적 변이, 삽입 결실(Indel), 유전자 복제수 변이(CNV)

선택 도구:

Library Prep and Array Kit Selector

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리소스

비디오 리소스

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Illumina 매핑된 리드 기술

 근접 매핑된 리드 기술을 살펴보십시오. 이 기술은 신속한 플로우 셀 라이브러리 준비와 인근 나노웰 의 근접 데이터를 통합하는 새로운 인포매틱스를 특징으로 하여 장거리 지노믹스 통찰력을 제공하고 탁월한 Whole genome assay 성능을 발휘합니다.

축소판

Steve Barnard 박사, 매핑된 리드 기술 소개

Illumina의 CTO인 Steve Barnard 박사는 인간 유전체 시퀀싱을 위한 매핑된 리드 기술을 소개하고, Niall Lennon 박사, Broad Clinical Labs의 의장 겸 CSO가 합류하여 예비 데이터와 통찰력을 공유합니다.

축소판

매핑된 리드 기술로 분석 수행하기

Illumina의 assay 연구 개발 부문 부담당자인 Louise Fraser 박사가 매핑된 리드 기술(이전의 컨스텔레이션 매핑 판독 기술)이 어떻게 작동하는지, 그리고 수행할 수 있는 분석의 유형에 대해 설명합니다.

기타 리소스

다양한 샘플에서 TruPath 유전체의 성능

TruPath 유전체는 다양한 출처의 여러 DNA 샘플, 서로 다른 품질의 샘플 및 다양한 사용한 수량 전반에서 성능을 발휘합니다.

Illumina 매핑된 리드 기술 

플로우 셀 라이브러리 프렙과 클러스터 근접 정보를 통해 장거리 지노믹 정보와 새로운 통찰력을 확보합니다

매핑된 리드 기술 소개 

매핑된 리드 기술은 매우 간소화된 NGS 워크플로우를 활용하여 시퀀싱 전에 표준 라이브러리 프렙을 완전히 제거하는 플로우 셀 라이브러리 프렙을 가능케 합니다

번들 솔루션 (2)

Illumina TruPath™ Genome (NovaSeq™ X C8 flow cell)

20157405

TruPath™ Genome NovaSeq X C8 Flow cell

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Illumina TruPath™ Genome (NovaSeq™ X C2 flow cell)

20157406

TruPath™ Genome NovaSeq X C2 Flow cell

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자주 묻는 질문

TruPath 유전체는 근접 매핑된 리드 기술을 사용합니다. 근접 매핑된 리드는 근처의 나노웰에 있는 클러스터의 근접 정보와 결합된 표준 쇼트 리드로, 정확한 장거리 지노믹스 통찰력을 생성합니다. 이 워크플로우는 원래의 긴 DNA 템플릿과 그로부터 생성된 짧은 시퀀싱 리드 간의 연결을 유지함으로써 구조적 변이의 향상된 검출, 유전적 변이의 초장거리 페이징 및 유전체의 매핑이 어려운 영역에서의 개선된 해상도를 가능하게 합니다.

 TruPath 유전체의 첫 번째 출시 제품은 인간 전장 유전체 시퀀싱을 위해 설계되었습니다.

 all-in TruPath 유전체 키트에는 시약과 기타 필수 시퀀싱 제품이 포함되어 있습니다.  현재 버전의 TruPath 유전체 는 NovaSeq X 시리즈 에서 v1.4 이상 소프트웨어로 시퀀싱 되어야 합니다. 포함된 DRAGEN Germline 분석은 로컬 DRAGEN Server 또는 클라우드 기반 Illumina Connected Analytics에서 수행될 수 있습니다.

정제된 유전체 DNA를 TruPath 태그멘테이션 버퍼에 희석하고 라이브러리 튜브 스트립에 추가한 다음 NovaSeq X 시약 카트리지에 삽입합니다. 그런 다음 TruPath 시약을 카트리지에 추가합니다. 카트리지와 플로우 셀을 NovaSeq X 시리즈 에 로드하고 실행을 시작합니다. 수작업 시간은 약 10분입니다.

DRAGEN Germline은 생식세포 변이 검출을 위한 2차 분석을 수행합니다. 데이터 분석은 로컬 DRAGEN Server에서 또는 Illumina Connected Analytics를 통해 클라우드에서 수행될 수 있습니다. 분석은 시퀀싱 데이터와 나노웰 근접 정보를 결합하여 DNA를 레퍼런스 시퀀스와 정렬합니다. 근접 매핑된 리드 정보를 활용하면 이전에는 참조 유전체에 매핑되지 않았거나 낮은 신뢰도로만 정렬할 수 있는 리드를 적절히 할당할 수 있습니다.  

/ 건

DRAGEN 주문

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Illumina Connected Analytics 주문

Illumina Connected Analytics를 통해 인포매틱스을 운영하고 과학적 인사이트을 촉진하세요. 가격, 구독 등에 대한 정보는 Illumina에 문의하세요.

DRAGEN 주문

Illumina DRAGEN 앱과 파이프라인을 통해 유전체학 인사이트를 극대화하고, 최신 업데이트에 대해 알아보고, FAQ를 읽고, 제품 지원을 찾아보세요.

DRAGEN Array

DRAGEN Array는 Infinium 마이크로어레이를 위한 정확하고 포괄적이며 효율적인 2차 분석을 제공합니다.

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