TruSight One 시퀀싱 패널

분석 민감도와 특이도가 높은 엑솜의 질병 관련 영역을 표적으로 하는 포괄적인 시퀀싱 연구 패널입니다.

6.5시간

Assay 시간

~2시간

수작업 시간

DNA 50 ng

사용량

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

TruSight One 및 TruSight One Expanded enrichment oligos는 이제 Illumina DNA Prep with Enrichment와 함께 사용할 수 있습니다. TruSight One용 Library prep kits(카탈로그 번호 FC-141-1006 및 FC-141-1007) 및 TruSight One Expanded(카탈로그 번호 FC-141-2007)은 중단되었습니다. 

개요

TruSight One 시퀀싱 패널은 다수의 유전체 데이터베이스와 업계 전문가들의 지침에 따라 질병 관련 유전자에 대한 폭넓은 콘텐츠와 높은 커버리지를 제공합니다. 

  • 최소 20× 커버리지로 인간 질병과 관련된 최대 6,700개의 유전자를 표적으로 함

  • 기존 메뉴를 확장하거나, 워크플로우를 간소화하거나, 단일 assay를 통해 시퀀싱 옵션으로 된 전체 포트폴리오 생성

  • 사용자가 정의한 유전자 필터링 및 보고서 생성으로 해석 간소화

두 가지 패널 옵션을 사용할 수 있는데, 이를 통해 임상 연구 검사실에 다양한 assay 포트폴리오를 관리하기 위한 합리적인 가격의 솔루션을 제공합니다.

TruSight One Sequencing Panel

이 패널은 특정한 임상적 표현형과 관련이 있는 > 4,800개의 질병 관련 유전자를 포함한 12 Mb의 유전체 콘텐츠에 대해 포괄적인 커버리지를 제공하여, 연구자들이 질병 관련성이 알려져 있는 유전자에 초점을 맞추도록 지원합니다. 

TruSight One Expanded 시퀀싱 패널

이 패널은 원래 패널을 더욱 최적화하여 커버리지를 개선합니다. 확장 패널은 총 16.5 Mb의 유전체 콘텐츠에 대해 원래 > 4,800개에 더해 약 1,900개의 추가적인 유전자를 표적으로 합니다. 

사양

필수 제품

다음 중 하나가 필요합니다. 

  • TruSight One Sequencing Combo 번들 솔루션(15개의 샘플을 지원하고 TruSight One – Enrichment Oligos kit 1개, Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation 16 samples 1개, MiSeq Reagent Kits v3, 600 cycles 5개) 구매 또는 

  • 각 패널을 위한 인리치먼트 올리고, 16개 또는 96개 샘플에 대한 인리치먼트 유무에 관계없이 Illumina DNA Prep 및 시스템을 위한 시퀀싱 시약의 별도 구매 

IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes(A–D)는 콤보 번들 솔루션을 선택하든 인리치먼트 및 라이브러리 준비를 별도로 구매하든 관계없이 별도로 구매해야 합니다.  

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애플리케이션

TruSight One 시퀀싱 패널은 질병 관련 표적 영역의 광범위한 콘텐츠와 높은 커버리지를 제공하여 검사실이 기존 메뉴를 확장하고, 워크플로우를 간소화하며, 반복 검사를 단일 assay로 바꾸도록 지원합니다. 

워크플로우 예시

프로젝트 권장 사항

기기 권장 샘플 수 리드 길이
MiSeq 시스템

TruSight One: v3 시약을 사용한 런당 샘플 수 3개

최대 2 × 150 bp 

NextSeq 550 시스템

TruSight One(런당 샘플 수): Mid-output: 12개, High-output: 36개  

TruSight One Expanded: 런당 샘플 수 24개(High-output) 

최대 2 × 150 bp 

최대 2 × 150 bp 

NextSeq 2000 시스템

TruSight One: 런당 샘플 수 96개(P3 플로우 셀) 

TruSight One Expanded: 런당 샘플 수 66개(P3 플로우 셀) 

최대 2 × 150 bp 

최대 2 × 150 bp

NovaSeq 6000 시스템

TruSight One Expanded: 런당 샘플 수 96개(S1 플로우 셀) 

최대 2 × 150 bp

샘플의 권장 수는 100× 표적 콘텐츠의 평균 커버리지를 기반으로 합니다.

관련 애플리케이션 및 방법

다른 사람들이 이 제품을 사용하는 방법

비교하기

TruSight One 시퀀싱 패널 Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment
Assay 시간 6.5시간 6.5시간
콘텐츠 사양 TruSight One: 유전체 콘텐츠 약 12 Mb(유전자 약 4,800개).
TruSight One Expanded: 유전체 콘텐츠 약 16.5 Mb(유전자 약 6,700개).
37.5 Mb 코딩 콘텐츠(≥ 99%의 RefSeq, CCDS, ClinVar 및 ACMG 병원체/병원체일 가능성이 있는 변이, COSMIC 암 유전자 센서스), OMIM
수작업 시간 ~2시간 약 2시간
사용량 DNA 50 ng 고품질 genomic DNA 50~1,000 ng(직접 혈액 및 타액의 경우, 참조 가이드 확인)
기기 MiSeq 시스템, NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, NextSeq 1000 시스템, MiSeqDx(Research Mode), MiniSeq 시스템, NextSeq 500 시스템, NovaSeq 6000 시스템 NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, NextSeq 1000 시스템, NextSeq 550Dx(Research Mode), NovaSeq X 시스템, NovaSeq 6000 시스템, NovaSeq X Plus 시스템
방법 표적 DNA 시퀀싱, 표적 인리치먼트 표적 DNA 시퀀싱, 엑솜 시퀀싱, 표적 인리치먼트
멀티플렉싱 최대 96플렉스 최대 12플렉스의 사전 인리치먼트 풀링이 테스트됩니다. 키트 구성은 최대 192개 샘플의 멀티플렉싱을 지원합니다. 최대 384개가 가능합니다.
핵산 종류 DNA DNA
특수 샘플의 종류 FFPE 호환 불가 혈액, 타액
종 카테고리 인간 인간
기술 시퀀싱 시퀀싱
변이 클래스 단일 염기 다형성(SNP), 생식세포 변이 단일 염기 다형성(SNP), 이형접합성 소실(LOH), 체세포 변이, 생식세포 변이, 삽입 결실(Indel), 유전자 복제수 변이(CNV)

선택 도구:

그림

TruSight One Sequencing Panel 전역 유전자 콘텐츠 기여자

TruSight One 패널은 알려져 있는 질병 관련 변이가 있는 유전체의 엑손 영역에 초점을 맞춥니다. 다수의 공개 출처로부터 받은 데이터를 결합하면 패널이 임상 연구 환경에서 현재 검토되고 있는 모든 유전자를 다룰 수 있게 됩니다.

TruSight One 및 Illumina 태그멘테이션 chemistry

TruSight One 인리치먼트 올리고는 Illumina 온비드·태그멘테이션(on-bead tagmentation) chemistry와 작용하여 표적 유전자의 인리치먼트를 위한 빠르고 단순한 방법을 제공합니다. 이 워크플로우는 라이브러리 준비 및 표적 인리치먼트 단계를 결합하고 1.5시간 만에 완료할 수 있습니다.

자원

TruSight 콘텐츠 세트 개발에 대한 협업적 접근법에 대해 들어 보세요.

번들 솔루션 (1)

TruSight One Sequencing Combo (15 Samples)

20042621

15개의 샘플에 충분하며 TruSight One – Enrichment Oligos(카탈로그 번호 20029227), Illumina® DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation(16 Samples)(카탈로그 번호 20025523), 5개의 MiSeq Reagent Kit v3(600-cycle)(카탈로그 번호 MS-102-3003)가 포함됩니다. IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes를 별도로 구매해 보세요.

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인리치먼트 패널 (2)

TruSight One – Enrichment Oligos only (6 Enrichment Reactions)

20029227

Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation과 함께 사용하면 6가지 인리치먼트 반응에 충분합니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 인덱스 어댑터를 별도로 구매해 보세요.

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TruSight One Expanded – Enrichment Oligos only (6 Enrichment Reactions)

20029226

Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation과 함께 사용하면 6가지 인리치먼트 반응에 충분합니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 인덱스 어댑터를 별도로 구매해 보세요.

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라이브러리 프렙 (4)

Illumina® DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (16 Samples)

20025523

16개의 라이브러리(16개의 1플렉스 인리치먼트 반응)를 준비하고 인리치먼트하기 위한 시약이 포함됩니다. 인리치먼트 프로브 패널, Illumina Purification Bead 및 인덱스 어댑터를 별도로 구매해 보세요.

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Illumina® DNA Prep, (S) Tagmentation (16 Samples)

20025519

16개의 라이브러리를 준비하기 위한 시약이 포함됩니다. 인리치먼트 시약은 포함되어 있지 않습니다. 인리치먼트 프로브 패널, Illumina Purification Bead 및 인덱스 어댑터를 별도로 구매해 보세요. 인리치먼트 시약은 라이브러리 준비 시약(Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (16 samples))과 함께 주문하는 것만 가능합니다.

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Illumina® DNA Prep, (S) Tagmentation (96 Samples)

20025520

96개의 라이브러리를 준비하기 위한 시약이 포함됩니다. 인리치먼트 시약은 포함되어 있지 않습니다. 인리치먼트 프로브 패널, Illumina Purification Bead 및 인덱스 어댑터를 별도로 구매해 보세요. 인리치먼트 시약은 라이브러리 준비 시약(Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (96 samples))과 함께 주문하는 것만 가능합니다.

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Illumina® DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (96 Samples)

20025524

96개의 라이브러리(8개의 12플렉스 인리치먼트 반응)를 준비하고 인리치먼트하기 위한 시약이 포함됩니다. 인리치먼트 프로브 패널, Illumina Purification Bead 및 인덱스 어댑터는 별도로 구매해 보세요.

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인덱스 어댑터 (8)

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091654

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개의 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10bp 인덱스가 포함됩니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091656

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10bp 인덱스가 포함됩니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091658

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10bp 인덱스가 포함됩니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091660

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10bp 인덱스가 포함됩니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매하세요.

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20027213

96개의 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10bp 인덱스가 포함됩니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20027214

96개의 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10bp 인덱스가 포함됩니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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Discounts:

IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20042666

96개의 샘플에 라벨을 부착하기에 충분한 96, 10 bp 인덱스 포함. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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Discounts:

IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20042667

96개의 검체 라벨링에 충분한 96, 10 bp 지수를 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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선택 품목 요약

제품

수량

단가

자주 묻는 질문

Illumina는 QuantiFluor 또는 PicoGreen 등의 이중 가닥 DNA에 특이적인 형광분석 기반 방법의 사용을 권장합니다. 더 많은 정보는 TruSight One 라이브러리 준비 가이드의 권장 사용량을 참조하세요.

Illumina는 태그멘테이션 및 인리치먼트 세척 단계 중에 마이크로히팅 시스템을 사용할 것을 권장합니다. Microheating 시스템을 사용할 수 없는 경우 열 순환기를 사용할 수 있습니다. 96-well 하드 쉘 플레이트를 사용하여 지침에 따라 태그멘테이션 반응을 설정해 보세요. 인리치먼트 세척 단계의 경우 대표본은 견고한 성능을 위해 프로토콜을 조정해야 합니다. 전체적인 세부 정보는 TruSight One 시퀀싱 패널 참조 가이드의 부록 A를 참조해 보세요.

TruSight One 시퀀싱 패널은 코딩 영역만을 표적으로 하고 UTR 또는 프로모터 영역은 포함하지 않습니다.
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NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 chemistry, 광학, 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 시퀀싱 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

MiSeq 시약 키트 v3

클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 최적화된 시약 키트로 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수가 향상되었습니다.

TruSight Oncology 500 v2

모든 주요 변이 클래스와 FFPE 조직에서 추출한 주요 바이오마커(TMB, MSI 및 HRD)를 다루는 대형 전체 고형암 패널을 통해 CGP를 지원합니다.

Illumina DNA Prep

광범위한 시퀀싱 애플리케이션에서 사용할 라이브러리를 준비하기 위한 빠르고 통합된 워크플로우입니다.

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