TruSight Cardio 시퀀싱 패널

이 키트는 연구자들에게 유전 심장 질환(ICC)과 관련이 있는 원인 변이를 식별하기 위한 포괄적이고 비용 효율적인 솔루션을 제공합니다.

TruSight Cardio enrichment oligos는 이제  Illumina DNA Prep with Enrichment와 함께 사용할 수 있습니다. MiSeq 및  MiSeqDx용 TruSight 심장 시퀀싱 키트(FC-141-1010)와 NextSeq용 TruSight 심장 시퀀싱 키트 (FC-141-1011 및 20035190)는 중단되었습니다.

TruSight Cardiomyopathy Sequencing Panel은 단종되었습니다. TruSight Cardio Sequencing Kit가 권장 교체품입니다.

개요

TruSight Cardio Panel은 차세대 시퀀싱(next-generation sequencing, NGS)을 사용하여 심근병증, 부정맥, 대동맥증 등 17개의 ICC와 관련성이 있는 것으로 알려져 있는 174개의 유전자에 대한 포괄적인 커버리지를 제공합니다. 유전자는 싱가포르 국립심장센터(National Heart Centre Singapore) 및 임페리얼 칼리지 런던(Imperial College of London)의 연구자들과 함께 전문적으로 선발했습니다. 콘텐츠에는 유전성 심장질환과 관련된 것으로 알려진 유전자와 문헌에서 확인할 수 있는 새로운 유전자가 포함되어 있습니다.1

  • 임페리얼 칼리지 런던(Imperial College of London)과의 협업으로 선발한 전문적으로 정의된 유전자

  • 표적 영역 중 99%는 최소 20×의 뎁스(depth) 커버리지에 포함됨*

  • 시퀀싱 비용은 유전자당 미화 약 $1, Illumina 시퀀싱 및 인포매틱스 플랫폼에서 완벽하게 지원됨

* Data on file. Illumina, Inc. 2015.

사양

애플리케이션

예시 워크플로우

프로젝트 권장 사항

기기 권장 샘플 수 리드 길이
MiSeq 시스템

12 samples per run with v2 reagents (based on 300x mean coverage of targeted content)

2 × 150 bp(최대 권장)

NextSeq 550 시스템

96 samples per run (mid output; based on 300x mean coverage of targeted content)

2 × 150 bp(최대 권장)

관련 애플리케이션 및 방법

비교하기

TruSight Cardio 시퀀싱 패널 TruSight One 시퀀싱 패널
콘텐츠 사양 575 Kb 유전체 콘텐츠(174개 유전자) TruSight One: 유전체 콘텐츠 약 12 Mb(유전자 약 4,800개).
TruSight One Expanded: 유전체 콘텐츠 약 16.5 Mb(유전자 약 6,700개).
설명 17가지 유전 심장 질환과 연관된 원인 변이를 식별하기 위한 표적 시퀀싱 연구 패널입니다.
사용량 DNA 50 ng DNA 50 ng
기기 MiSeq 시스템, NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, NextSeq 1000 시스템, MiSeqDx(Research Mode), MiniSeq 시스템, NextSeq 500 시스템 MiSeq 시스템, NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, NextSeq 1000 시스템, MiSeqDx(Research Mode), MiniSeq 시스템, NextSeq 500 시스템, NovaSeq 6000 시스템
방법 표적 DNA 시퀀싱, 표적 인리치먼트 표적 DNA 시퀀싱, 표적 인리치먼트
멀티플렉싱 최대 96플렉스 최대 96플렉스
핵산 종류 DNA DNA
특수 샘플의 종류 FFPE 호환 불가 FFPE 호환 불가
종 카테고리 인간 인간
기술 시퀀싱 시퀀싱
변이 클래스 단일 염기 다형성(SNP), 생식세포 변이 단일 염기 다형성(SNP), 생식세포 변이

리소스

축소판

Dr. Stuart Cook: Targeted gene analysis with TruSight Cardio Sequencing

이 참조 가이드를 다운로드하여 연구를 지원하려면 어떤 키트 수량을 구매해야 하는지 이해해 보세요.

인리치먼트 패널 (1)

TruSight Cardio – Enrichment Oligos only (8 Enrichment Reactions)

20029229

Illumina DNA Prep with Enrichment와 함께 사용하면 8가지 인리치먼트 반응에 충분합니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 인덱스 어댑터는 별도로 구매해 보세요.

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라이브러리 프렙 (4)

Illumina® DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (16 Samples)

20025523

16개의 라이브러리(16개의 1플렉스 인리치먼트 반응)를 준비하고 인리치먼트하기 위한 시약이 포함됩니다. 인리치먼트 프로브 패널, Illumina Purification Bead 및 인덱스 어댑터를 별도로 구매해 보세요.

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Illumina® DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (96 Samples)

20025524

96개의 라이브러리(8개의 12플렉스 인리치먼트 반응)를 준비하고 인리치먼트하기 위한 시약이 포함됩니다. 인리치먼트 프로브 패널, Illumina Purification Bead 및 인덱스 어댑터는 별도로 구매해 보세요.

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Illumina® DNA Prep, (S) Tagmentation (16 Samples)

20025519

16개의 라이브러리를 준비하기 위한 시약이 포함됩니다. 인리치먼트 시약은 포함되어 있지 않습니다. 인리치먼트 프로브 패널, Illumina Purification Bead 및 인덱스 어댑터를 별도로 구매해 보세요. 인리치먼트 시약은 라이브러리 준비 시약(Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (16 samples))과 함께 주문하는 것만 가능합니다.

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Illumina® DNA Prep, (S) Tagmentation (96 Samples)

20025520

96개의 라이브러리를 준비하기 위한 시약이 포함됩니다. 인리치먼트 시약은 포함되어 있지 않습니다. 인리치먼트 프로브 패널, Illumina Purification Bead 및 인덱스 어댑터를 별도로 구매해 보세요. 인리치먼트 시약은 라이브러리 준비 시약(Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (96 samples))과 함께 주문하는 것만 가능합니다.

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액세서리 제품 (4)

IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20027213

96개의 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10bp 인덱스가 포함됩니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20027214

96개의 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10bp 인덱스가 포함됩니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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IDT® for Illumina Nextera DNA Unique Dual Indexes Set C (96 Indexes, 96 Samples)

20027215

Illumina용 IDT- Nextera UD 인덱스- 세트 C에는 96개의 샘플에 충분한 96, 10bp 고유 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비, 인리치먼트 및 인리치먼트 프로브 패널 시약은 별도로 주문해야 합니다.

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IDT® for Illumina Nextera DNA Unique Dual Indexes Set D (96 Indexes, 96 Samples)

20027216

Illumina용 IDT- Nextera UD 인덱스- 세트 D에는 96개의 샘플에 충분한 96, 10bp 고유 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비, 인리치먼트 및 인리치먼트 프로브 패널 시약은 별도로 주문해야 합니다.

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선택 품목 요약

제품

수량

단가

NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 chemistry, 광학, 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 시퀀싱 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

MiSeq 시약 키트 v3

클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 최적화된 시약 키트로 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수가 향상되었습니다.

TruSight Oncology 500 v2

모든 주요 변이 클래스와 FFPE 조직에서 추출한 주요 바이오마커(TMB, MSI 및 HRD)를 다루는 대형 전체 고형암 패널을 통해 CGP를 지원합니다.

Illumina DNA Prep

광범위한 시퀀싱 애플리케이션에서 사용할 라이브러리를 준비하기 위한 빠르고 통합된 워크플로우입니다.

참고 문헌

1. Pua CJ, Bhalshankar J, Miao K, et al. Development of a comprehensive sequencing assay for inherited cardiac condition genes. J Cardiovasc Trans Res. 2016;9:3.

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