MiSeq系统的规格

MiSeq提供了短的测序运行时间和长的读长,同时维持了高的数据质量。

MiSeq的规格

  MiSeq Reagent Kit v2 MiSeq Reagent Kit v3
读长 1 × 36 bp 2 × 25 bp 2 × 150 bp 2 × 250 bp 2 × 75 bp 2 × 300 bp
总时间* ~4小时 ~5.5小时 ~24 小时 ~39小时 ~21小时 ~56小时
产出 540–610 Mb 750–850 Mb 4.5–5.1 Gb 7.5–8.5 Gb 3.3–3.8 Gb 13.2–15 Gb
  MiSeq Reagent Kit v2 Micro MiSeq Reagent Kit v2 Nano
读长 2 × 150 bp 2 × 250 bp 2 × 150 bp
总时间* ~19小时 ~28小时 ~17小时
产出 1.2 Mb 500 Mb 300 Mb

* 总时间包括MiSeq系统上双表面扫描所实现的簇生成、测序和碱基检出。

  MiSeq Reagent Kit v2 MiSeq Reagent Kit v3 MiSeq Reagent Kit v2 Micro MiSeq Reagent Kit v2 Nano
单端Read 12–15 million 22–25 million 4 million 1 million
双端Read 24–30 million 44–50 million 8 million 2 million

** 安装参数是基于在所支持的簇密度下运行Illumina PhiX对照文库 (对于V2版本,通过过滤的簇密度是865-965 k/mm2 ;对于V3版本,通过的簇密度是 1200-1400 k/mm2 )。根据样本类型、样本质量、通过过滤的簇的不同,真实的性能参数可能有所差异。

MiSeq Reagent Kit v2 MiSeq Reagent Kit v3
在1 × 36 bp时,> 90%的碱基高于Q30 在2 × 75 bp时,> 85%的碱基高于Q30
在2 × 25 bp时,> 90%的碱基高于Q30 在2 × 300 bp时,> 70%的碱基高于Q30
在2 × 150 bp时,> 80%的碱基高于Q30  
在2 × 250 bp时,> 75%的碱基高于Q30  

† 总时间包括NextSeq 500系统上双表面扫描所实现的簇生成、测序和碱基检出。

MiSeq System Specification Sheet

MiSeq系统参数表

Miseq系统提供了从DNA到结果的测序解决方案,占地面积小,不会占用实验室额外的空间。

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边合成边测序(SBS)技术

MiSeq系统使用成熟的Illumina SBS技术,在广泛的应用中数据精度高,性能扎实稳健。SBS采用可逆终止子的方法,其中经荧光标记的核苷酸可以在单碱基掺入不断增长的DNA链时发现它们。

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双端测序技术

双端测序技术能够对DNA片段序列的两端进行测序。因为每对read之间的距离是已知的,比对算法可以利用此信息来标示read。对于基因组中难以测序的、重复的区域,此技术特别有用。

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