HiSeq 2500系统的性能规格

HiSeq 2500具有高产出和快速运行模式,为高通量的测序应用提供了一个灵活的解决方案

HiSeq 2500的规格

试剂盒参数
HiSeq SBS V4
读长 1 × 36 bp 2 × 50 bp 2 × 100 bp 2 × 125 bp
双流动槽 128–144 Gb 360–400 Gb 720–800 Gb 900 Gb–1 Tb
单流动槽 64–72 Gb 180–200 Gb 360–400 Gb 450–500 Gb
双流动槽运行时间 29小时 2.5天 5天 6天
TruSeq SBS V3
读长 1 × 36 bp 2 × 50 bp 2 × 100 bp 2 × 125 bp
双流动槽 95–105 Gb 270–300 Gb 540–600 Gb N/A
单流动槽 47–52 Gb 135–150 Gb 270–300 Gb N/A
双流动槽运行时间 2天 5.5天 11天 N/A
附加的试剂盒参数
HiSeq SBS V4
流动槽类型 双流动槽 单流动槽
通过过滤的read(每个流动槽有8个通道) 高达40亿条单端read,或80亿条双端reads 高达20亿条单端read,或40亿条双端reads
质量
  • 在2 x 50 bp时,超过85%的碱基高于Q30
  • 在2 x 100 bp时,超过80%的碱基高于Q30
  • 在2 x 125 bp时,超过80%的碱基高于Q30
TruSeq SBS V3
流动槽类型 双流动槽 单流动槽
通过过滤的read(每个流动槽有8个通道) 高达30亿条单端read,或60亿条双端reads 高达15亿条单端read,或30亿条双端reads
质量
  • 在2 x 50 bp时,超过85%的碱基高于Q30
  • 在2 x 100 bp时,超过80%的碱基高于Q30

*安装参数是根据在所支持的簇密度下运行Illumina PhiX对照文库所得(利用TruSeq v3试剂盒,通过过滤的簇密度是610–678 K/mm2,利用HiSeq v4,通过过滤的簇密度是870–930 K/mm2。高产出模式的运行时间只对应于测序本身。根据样本质量、簇密度及其他实验因素的不同,性能可能会有所差异。

试剂盒参数
HiSeq Rapid SBS Kit V2
读长 1 × 36 bp 2 × 50 bp 2 × 100 bp 2 × 150 bp 2 × 250 bp
双流动槽 18–22 Gb 50–60 Gb 100–120 Gb 150–180 Gb 250–300 Gb
单流动槽 9–11 Gb 25–30 Gb 50–60 Gb 75–90 Gb 125–150 Gb
双流动槽运行时间 7小时 16小时 27小时 40小时 60小时
附加的试剂盒参数
HiSeq Rapid SBS Kit V2
流动槽类型 双流动槽 单流动槽
通过过滤的read(每个流动槽有2个通道) 高达6亿条单端read,或12亿条双端read 高达3亿条单端read,或6亿条双端read
质量
  • 在2 x 50 bp时,超过85%的碱基高于Q30
  • 在2 x 100 bp时,超过80%的碱基高于Q30
  • 在2 x 250 bp时,超过75%的碱基高于Q30

† 安装参数是基于在所支持的簇密度下运行Illumina PhiX对照文库所得(利用HiSeq Rapid v2 Kit,通过过滤的簇密度是700–820 K/mm2。高产出模式的运行时间只对应于仪器上簇生成(1.5小时)和测序。根据样本质量、簇密度及其他实验因素的不同,性能可能有所差异。早期的HiSeq 2000仪器在升级到HiSeq 2500后,运行速度略微减慢。

MiSeq FGx System Specification Sheet

HiSeq 2500系统的规格表

强大高效,适合生产规模的测序。

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边合成边测序(SBS)技术

HiSeq 2500系统利用成熟的Illumina SBS技术来产生准确的数据和可靠的性能,适合广泛的应用。SBS技术利用一种可逆终止子方法和荧光标记的寡核苷酸,在单个碱基掺入不断增长的DNA链时检测它们。

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双端测序技术

双端测序让DNA片段的两端都能被测序。由于每一对read之间的距离是已知的,故比对算法可利用这一信息,将read更精确地定位到重复区域。这带来了更好的read比对,特别是对于基因组中那些难以测序的重复区域。

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