检测癌症转录组的变化

RNA-Seq提供了驱动肿瘤发展的癌症基因表达和基因融合的功能信息

癌症RNA测序

通过癌症RNA测序(RNA-Seq)监控基因表达和转录组的变化能协助了解肿瘤分类和发展。癌症积累了许多遗传改变,但通常只有少数能驱动肿瘤发展。癌症RNA-Seq能帮助鉴别哪些变异在癌症样本中表达。

转录组测序

测序编码区或整个癌症转录组能够提供肿瘤中基因表达变化的宝贵信息。癌症RNA-Seq可检测链特异的信息,这是基因调控中一个重要的部分。癌症转录组测序捕获编码和非编码RNA,并提供链方向,提供表达动力学的完整视图。

深入了解RNA-Seq

靶向RNA扩增子测序分析特定癌基因表达。预先设计的癌基因表达集合侧重于特定的通路,如p53和NF-KB。研究人员可添加定制内容,拓宽实验的视野。

深入了解靶向扩增子RNA-Seq

带有缺失或扩增的miRNA位点的基因组区域已知与多种癌症相关联。Small RNA-Seq使得研究人员能够发现和分析癌症转录组中存在的miRNA及其他小的非编码RNA。

深入了解Small RNA-Seq

福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)的肿瘤样本可能包含了癌症发病机理和治疗效果等宝贵信息。由于FFPE样本通常含有部分降解的RNA,让癌症RNA-Seq面临挑战。新一代RNA-Seq方法让研究人员能够获取这些重要数据,从降解和FFPE来源的RNA中产生高质量的结果。

深入了解FFPE样本的RNA-Seq
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Illumina为癌症的全基因组测序提供了几种文库制备、测序和数据分析的选择。简化的文库制备流程和灵活的试剂盒配置适合多种研究设计。Illumina的系统带来了业界领先的数据质量 – 事实上,全世界大约90%的测序数据是利用Illumina的边合成边测序(SBS)技术生成的。

BaseSpace中按键式的应用程序简化了数据分析,这样您用更多的时间去关注新突破,而用更少的时间分析数据。

单击下面的 可查看每个工作流程步骤的产品。

TruSight RNA Pan-Cancer

在包括FFPE在内的所有RNA样品类型中靶定1385个肿瘤基因,从而实现基因表达、变异和融合的检测。

TruSeq RNA Access Library Prep Kit

一个对FFPE及其他低质量样品中的编码RNA进行测序的经济且可重复的方法。

TruSeq Targeted RNA Expression Kit

专为癌症基因表达图谱分析而预设计或用户定制的产品。

TruSeq Small RNA Library Prep Kit

灵敏的microRNA分析试剂盒。

TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit

准确测定mRNA链的方向,以检测反义转录及发现选择性转录本、基因融合和等位基因特异的表达。

TruSeq Stranded Total RNA Library Prep Kit

一个可扩展的全转录组分析方案,可提供准确的链信息,从而让您全面了解转录组。

NeoPrep系统

一个简单易用的系统,专门制备高质量NGS文库,且与Illumina所有测序平台兼容。

TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit for NeoPrep

与NeoPrep系统兼容,可从少量RNA中产生高质量、可重现的文库。

MiniSeq系统

最简单、最经济的方案,适合低通量的靶向基因表达谱分析。

MiSeq系统

台式测序仪,特有一个简单的NGS流程,集成的数据分析软件,以及无可匹敌的准确性。

MiSeqDx系统

经过FDA批准的体外诊断NGS系统,也可在研究模式下操作,产生准确且可靠的数据。

NextSeq系列

灵活的台式测序系统,可以开展各种癌症RNA-Seq应用,包括全转录组分析和癌症基因表达谱分析。

HiSeq 2500系统

适合大规模的癌症RNA-Seq实验的高通量系统。

HiSeq 3000/HiSeq 4000系统

适合生产规模的癌症RNA-Seq实验的超高通量系统。

RNA Express App

利用STAR aligner比对RNA序列,接着用DESeq2开展差异表达分析。

TopHat Alignment App

开展RNA样品的剪接比对、变异检出和参考定量。

Cufflinks Assembly & DE App

开展RNA样品的新颖转录本组装和差异表达分析。

MiSeq Reporter

易于使用的软件,适用于MiSeq系统上的分析和变异检出。

BaseSpace Sequence Hub

Illumina适用于NGS数据分析和管理的基因组学计算环境。

BaseSpace Correlation Engine

一个不断增长的专业基因组数据库,可支持研究人员鉴定疾病机制、药物靶点以及预后或预测的生物标志物。

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癌症RNA-Seq用于转录组分析

深入了解RNA-Seq用于单细胞的癌症转录组分析。

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高通量的基因组学技术用于癌症研究

看一看癌症RNA-Seq如何为肿瘤中的基因表达提供详细信息。

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癌症和免疫系统研究综述

近期探索肿瘤细胞与免疫系统相互作用的研究文献概览。

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癌症研究综述

以Illumina技术为特色的近期癌症研究文献概览。

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Integrative Genomics to Inform Cancer Prognosis
整合基因组学以告知癌症预后

综合了DNA和RNA水平的数据的分子表达谱可更加轻松地鉴定那些可能驱动癌症的基因。

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