深入研究那些影响肿瘤生物学的编码突变

缩小关注范围,实现相关区域的经济测序

癌症全外显子组测序

癌症外显子组的测序提供了有关促成肿瘤发展的编码突变的有用信息。由于外显子组只占基因组的< 2%,癌症外显子测序可作为全基因组测序的经济替代方法。与全基因组方法相比,外显子组测序可产生更容易管理的数据集。

外显子组测序让癌症研究人员能够只评估编码区域,因为它们最有可能含有影响肿瘤发展的突变。癌症外显子组测序的内容也可扩展到非翻译区和miRNA结合位点,这取决于实验需求。由于它能实现运行时间和价格相宜的亲民组合,外显子组测序已成为许多肿瘤-正常样本比较的首选方法。

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文库制备和外显子组富集是外显子组测序实验成功的关键。对于癌症外显子组测序,富集有限DNA样本的能力尤为重要。均一、特异地外显子组富集方法能实现编码变异的可靠鉴定。

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Illumina为癌症的全基因组测序提供了几种文库制备、测序和数据分析的选择。简化的文库制备流程和灵活的试剂盒配置适合多种研究设计。Illumina的系统能提供业界领先的数据质量 – 事实上,全世界大约90%的测序数据是利用Illumina的边合成边测序(SBS)技术生成的。

BaseSpace中按键式的应用程序能简化数据分析,这样您可以使用更多时间关注新突破的,而花费更少时间用来分析数据。

单击下面的 可查看每个工作流程步骤的产品。

Nextera Rapid Capture Exome and Expanded Exome Kits

文库制备和外显子组富集可在短短1.5天内完成,测序量仅为4 Gb。

NextSeq Series

配置灵活,每次运行最多支持12个外显子组。

HiSeq 2500系统

通量最高,每次运行可测序数十至数百个癌症外显子组。

HiSeq 3000/HiSeq 4000系统

图案化流动槽技术带来更高的通量,每个样品的更低价格,以及增强的速度和性能。

BWA Enrichment App

使用BWA Genome Alignment软件和GATK Variant Caller进行外显子组数据分析。

Isaac Enrichment App

使用Isaac Genome Alignment软件和Isaac Variant Caller进行外显子组数据分析。

BaseSpace Sequence Hub

Illumina适用于NGS数据分析和管理的基因组学计算环境。

外显子组测序分析稀有的肿瘤细胞
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看一看Nicholas Navin博士如何利用Nextera Rapid Capture Exome Kit分析肿瘤亚群。

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外显子组测序的资源
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FFPE癌症外显子组测序
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