改进育种和选种

了解遗传和表观遗传因素在特定物种的性状中所发挥的作用,或者是追踪微生物适应作用

植物和动物测序

De Novo 植物和动物测序

无论一个研究项目是关注新物种,还是之前从未使用遗传工具研究过的物种,de novo 测序和新一代测序 (NGS) 都是了解植物或动物的功能及其与环境相互作用的遗传基础的第一步。有了长的paired和mate-pair序列数据,一些研究人员能利用组装好的基因组来指定图谱位置和育种信息,以便在后续的重测序中能发现SNP及其他遗传变异。

Plant and Animal Sequencing
 
全基因组重测序

有了一个物种的参考基因组后,全基因组重测序是一种有效的方法,可用于发现基因、SNP和结构变异,并同时确定基因型。这些研究的结果将填补许多动植物遗传图谱中存在的缺口,改进植物育种和选择,实现物种内和物种间明确的比较基因组分析。

动植物转录组分析

RNA 测序正在彻底改变动植物基因表达的研究,为发育以及疾病和压力条件下发生的表达水平变化提供新的见解。它用来阐明基因和蛋白质的功能及相互作用,鉴定动物或植物基因组所产生的组织特异的RNA转录本列表(mRNA、非编码RNA和小RNA),及用于SNP发现。

动植物表观遗传学

对环境变化(食物供应、干旱条件等)的适应性反应可引发植物和动物的表型变化,从而影响它们的生存能力和生殖健康。利用测序来鉴定DNA甲基化、染色质结构和小RNA表达的变化,研究人员可以更好地理解表观遗传学因素如何控制感兴趣物种的相应性状。

靶向重测序

靶向重测序深入研究外显子组或特定的基因组区域,这些区域是从大型的关联或连锁研究中鉴定出来的。这种高效而经济的方法对大量样品中预先确定的遗传变异区域进行测序,并鉴定出常见和稀有的变异(SNP、CNV等)。这些变异可能代表了有益的突变,帮助做出育种决策,也可能揭示致病突变,它们引起了动植物疾病或寄生虫易感性。

基于测序的基因分型

基于测序的基因分型(GBS), 或新一代基因分型(NGG),为发现新的植物和动物SNP和开展基因分型研究提供了一种低成本的遗传筛查方法,往往在多个标本中同时开展。有了这个低成本的常规筛查工具,研究人员可加速育种实践中的投资回报。这种方法的应用包括遗传作图,筛查回交系,纯度检测,构建单体型图谱,以及开展植物农业基因组学研究的关联和基因组选择。

土壤和农业宏基因组学

测序已经改变了环境基因组学,让大型微生物群落可在其天然环境中进行研究,而不需要预先培养。这些研究可从与动物和植物发育相关的复杂而多样的微生物群落中得到重要信息,这些微生物群落包括从增强动物消化的瘤胃菌群到参与固氮的根相关细菌。

新一代测序(NGS)一直在推进微生物研究。有了NGS,您能够测定基因组中任何位置的变化,而无需先验知识,这对无法培养的微生物尤其关键。单碱基分辨率让您能够追踪短期内微生物在实验室和环境中的适应情况。

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